Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM9

Psma6, Proteasome subunit alpha type-6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma6Q9QUM9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Psma6Q9QUM9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psma6Q9QUM9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psma6Q9QUM9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psma6Q9QUM9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psma6Q9QUM9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psma6Q9QUM9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psma6Q9QUM9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psma6Q9QUM9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psma6Q9QUM9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psma6Q9QUM9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psma6Q9QUM9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psma6Q9QUM9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psma6Q9QUM9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Psma6Q9QUM9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psma6Q9QUM9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psma6Q9QUM9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psma6Q9QUM9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psma6Q9QUM9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psma6Q9QUM9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psma6Q9QUM9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psma6Q9QUM9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psma6Q9QUM9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psma6Q9QUM9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psma6Q9QUM9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psma6Q9QUM9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psma6Q9QUM9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psma6Q9QUM9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psma6Q9QUM9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psma6Q9QUM9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psma6Q9QUM9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psma6Q9QUM9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psma6Q9QUM9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psma6Q9QUM9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psma6Q9QUM9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psma6Q9QUM9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psma6Q9QUM9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psma6Q9QUM9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psma6Q9QUM9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psma6Q9QUM9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psma6Q9QUM9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psma6Q9QUM9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psma6Q9QUM9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psma6Q9QUM9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Psma6Q9QUM9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psma6Q9QUM9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psma6Q9QUM9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psma6Q9QUM9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psma6Q9QUM9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psma6Q9QUM9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psma6Q9QUM9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psma6Q9QUM9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psma6Q9QUM9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psma6Q9QUM9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psma6Q9QUM9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psma6Q9QUM9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psma6Q9QUM9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psma6Q9QUM9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psma6Q9QUM9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psma6Q9QUM9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psma6Q9QUM9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psma6Q9QUM9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psma6Q9QUM9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psma6Q9QUM9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psma6Q9QUM9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psma6Q9QUM9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psma6Q9QUM9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psma6Q9QUM9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psma6Q9QUM9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psma6Q9QUM9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psma6Q9QUM9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psma6Q9QUM9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psma6Q9QUM9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psma6Q9QUM9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psma6Q9QUM9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Psma6Q9QUM9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psma6Q9QUM9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psma6Q9QUM9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psma6Q9QUM9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psma6Q9QUM9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psma6Q9QUM9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psma6Q9QUM9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psma6Q9QUM9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psma6Q9QUM9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psma6Q9QUM9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psma6Q9QUM9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psma6Q9QUM9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psma6Q9QUM9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psma6Q9QUM9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psma6Q9QUM9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psma6Q9QUM9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Psma6Q9QUM9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psma6Q9QUM9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psma6Q9QUM9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psma6Q9QUM9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Psma6Q9QUM9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Psma6Q9QUM9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psma6Q9QUM9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psma6Q9QUM9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psma6Q9QUM9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms