Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM0

Itga2b, Integrin alpha-IIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,033 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga2bQ9QUM0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itga2bQ9QUM0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itga2bQ9QUM0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itga2bQ9QUM0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itga2bQ9QUM0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itga2bQ9QUM0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itga2bQ9QUM0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itga2bQ9QUM0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Itga2bQ9QUM0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Itga2bQ9QUM0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itga2bQ9QUM0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Itga2bQ9QUM0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Itga2bQ9QUM0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itga2bQ9QUM0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itga2bQ9QUM0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itga2bQ9QUM0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itga2bQ9QUM0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Itga2bQ9QUM0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itga2bQ9QUM0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itga2bQ9QUM0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itga2bQ9QUM0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itga2bQ9QUM0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itga2bQ9QUM0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itga2bQ9QUM0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itga2bQ9QUM0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itga2bQ9QUM0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itga2bQ9QUM0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itga2bQ9QUM0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itga2bQ9QUM0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itga2bQ9QUM0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itga2bQ9QUM0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itga2bQ9QUM0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itga2bQ9QUM0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itga2bQ9QUM0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itga2bQ9QUM0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itga2bQ9QUM0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itga2bQ9QUM0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itga2bQ9QUM0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itga2bQ9QUM0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Itga2bQ9QUM0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itga2bQ9QUM0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itga2bQ9QUM0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Itga2bQ9QUM0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itga2bQ9QUM0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itga2bQ9QUM0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itga2bQ9QUM0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itga2bQ9QUM0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itga2bQ9QUM0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itga2bQ9QUM0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itga2bQ9QUM0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itga2bQ9QUM0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itga2bQ9QUM0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itga2bQ9QUM0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itga2bQ9QUM0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itga2bQ9QUM0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itga2bQ9QUM0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Itga2bQ9QUM0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itga2bQ9QUM0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itga2bQ9QUM0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itga2bQ9QUM0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itga2bQ9QUM0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itga2bQ9QUM0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itga2bQ9QUM0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itga2bQ9QUM0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itga2bQ9QUM0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itga2bQ9QUM0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itga2bQ9QUM0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itga2bQ9QUM0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itga2bQ9QUM0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itga2bQ9QUM0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itga2bQ9QUM0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itga2bQ9QUM0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itga2bQ9QUM0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itga2bQ9QUM0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itga2bQ9QUM0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itga2bQ9QUM0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itga2bQ9QUM0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itga2bQ9QUM0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itga2bQ9QUM0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itga2bQ9QUM0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itga2bQ9QUM0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itga2bQ9QUM0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itga2bQ9QUM0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itga2bQ9QUM0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itga2bQ9QUM0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga2bQ9QUM0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga2bQ9QUM0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga2bQ9QUM0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga2bQ9QUM0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga2bQ9QUM0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga2bQ9QUM0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga2bQ9QUM0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga2bQ9QUM0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga2bQ9QUM0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga2bQ9QUM0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itga2bQ9QUM0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itga2bQ9QUM0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itga2bQ9QUM0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itga2bQ9QUM0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itga2bQ9QUM0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms