Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hdgfl3Q9JMG7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms