Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME5

Ap3b2, AP-3 complex subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b2Q9JME5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ap3b2Q9JME5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ap3b2Q9JME5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ap3b2Q9JME5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ap3b2Q9JME5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ap3b2Q9JME5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ap3b2Q9JME5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ap3b2Q9JME5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ap3b2Q9JME5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ap3b2Q9JME5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ap3b2Q9JME5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ap3b2Q9JME5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ap3b2Q9JME5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Ap3b2Q9JME5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ap3b2Q9JME5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ap3b2Q9JME5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ap3b2Q9JME5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ap3b2Q9JME5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ap3b2Q9JME5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ap3b2Q9JME5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ap3b2Q9JME5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ap3b2Q9JME5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ap3b2Q9JME5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ap3b2Q9JME5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ap3b2Q9JME5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ap3b2Q9JME5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Ap3b2Q9JME5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ap3b2Q9JME5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ap3b2Q9JME5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ap3b2Q9JME5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ap3b2Q9JME5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ap3b2Q9JME5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ap3b2Q9JME5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ap3b2Q9JME5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ap3b2Q9JME5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ap3b2Q9JME5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Ap3b2Q9JME5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ap3b2Q9JME5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ap3b2Q9JME5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ap3b2Q9JME5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ap3b2Q9JME5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ap3b2Q9JME5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Ap3b2Q9JME5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ap3b2Q9JME5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ap3b2Q9JME5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ap3b2Q9JME5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ap3b2Q9JME5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ap3b2Q9JME5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ap3b2Q9JME5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Ap3b2Q9JME5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ap3b2Q9JME5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ap3b2Q9JME5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ap3b2Q9JME5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Ap3b2Q9JME5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ap3b2Q9JME5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ap3b2Q9JME5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ap3b2Q9JME5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ap3b2Q9JME5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ap3b2Q9JME5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ap3b2Q9JME5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ap3b2Q9JME5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Ap3b2Q9JME5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ap3b2Q9JME5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ap3b2Q9JME5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ap3b2Q9JME5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ap3b2Q9JME5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ap3b2Q9JME5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ap3b2Q9JME5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ap3b2Q9JME5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ap3b2Q9JME5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ap3b2Q9JME5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ap3b2Q9JME5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ap3b2Q9JME5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Ap3b2Q9JME5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Ap3b2Q9JME5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Ap3b2Q9JME5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ap3b2Q9JME5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ap3b2Q9JME5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ap3b2Q9JME5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ap3b2Q9JME5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ap3b2Q9JME5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ap3b2Q9JME5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ap3b2Q9JME5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ap3b2Q9JME5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ap3b2Q9JME5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ap3b2Q9JME5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ap3b2Q9JME5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ap3b2Q9JME5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Ap3b2Q9JME5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ap3b2Q9JME5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ap3b2Q9JME5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ap3b2Q9JME5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ap3b2Q9JME5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ap3b2Q9JME5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ap3b2Q9JME5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ap3b2Q9JME5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ap3b2Q9JME5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ap3b2Q9JME5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ap3b2Q9JME5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ap3b2Q9JME5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.4 ms