Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM62

Reep6, Receptor expression-enhancing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep6Q9JM62 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Reep6Q9JM62 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Reep6Q9JM62 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Reep6Q9JM62 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Reep6Q9JM62 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Reep6Q9JM62 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Reep6Q9JM62 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Reep6Q9JM62 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Reep6Q9JM62 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Reep6Q9JM62 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Reep6Q9JM62 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Reep6Q9JM62 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Reep6Q9JM62 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Reep6Q9JM62 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Reep6Q9JM62 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Reep6Q9JM62 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Reep6Q9JM62 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Reep6Q9JM62 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Reep6Q9JM62 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Reep6Q9JM62 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Reep6Q9JM62 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Reep6Q9JM62 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Reep6Q9JM62 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Reep6Q9JM62 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Reep6Q9JM62 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Reep6Q9JM62 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Reep6Q9JM62 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Reep6Q9JM62 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Reep6Q9JM62 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Reep6Q9JM62 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Reep6Q9JM62 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Reep6Q9JM62 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Reep6Q9JM62 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Reep6Q9JM62 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Reep6Q9JM62 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Reep6Q9JM62 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Reep6Q9JM62 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Reep6Q9JM62 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Reep6Q9JM62 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Reep6Q9JM62 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Reep6Q9JM62 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Reep6Q9JM62 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Reep6Q9JM62 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Reep6Q9JM62 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Reep6Q9JM62 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Reep6Q9JM62 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Reep6Q9JM62 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Reep6Q9JM62 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Reep6Q9JM62 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Reep6Q9JM62 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Reep6Q9JM62 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Reep6Q9JM62 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Reep6Q9JM62 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Reep6Q9JM62 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Reep6Q9JM62 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Reep6Q9JM62 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Reep6Q9JM62 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Reep6Q9JM62 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Reep6Q9JM62 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Reep6Q9JM62 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Reep6Q9JM62 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Reep6Q9JM62 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Reep6Q9JM62 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Reep6Q9JM62 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Reep6Q9JM62 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Reep6Q9JM62 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Reep6Q9JM62 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Reep6Q9JM62 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Reep6Q9JM62 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Reep6Q9JM62 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Reep6Q9JM62 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Reep6Q9JM62 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Reep6Q9JM62 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Reep6Q9JM62 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Reep6Q9JM62 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Reep6Q9JM62 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Reep6Q9JM62 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Reep6Q9JM62 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Reep6Q9JM62 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Reep6Q9JM62 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Reep6Q9JM62 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Reep6Q9JM62 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Reep6Q9JM62 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Reep6Q9JM62 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Reep6Q9JM62 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Reep6Q9JM62 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Reep6Q9JM62 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Reep6Q9JM62 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Reep6Q9JM62 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Reep6Q9JM62 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Reep6Q9JM62 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Reep6Q9JM62 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Reep6Q9JM62 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Reep6Q9JM62 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Reep6Q9JM62 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Reep6Q9JM62 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Reep6Q9JM62 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Reep6Q9JM62 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Reep6Q9JM62 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Reep6Q9JM62 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms