Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tlr5Q9JLF7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tlr5Q9JLF7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tlr5Q9JLF7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tlr5Q9JLF7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tlr5Q9JLF7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tlr5Q9JLF7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tlr5Q9JLF7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tlr5Q9JLF7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tlr5Q9JLF7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tlr5Q9JLF7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tlr5Q9JLF7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tlr5Q9JLF7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tlr5Q9JLF7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tlr5Q9JLF7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tlr5Q9JLF7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Tlr5Q9JLF7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tlr5Q9JLF7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tlr5Q9JLF7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tlr5Q9JLF7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tlr5Q9JLF7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tlr5Q9JLF7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tlr5Q9JLF7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tlr5Q9JLF7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tlr5Q9JLF7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tlr5Q9JLF7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tlr5Q9JLF7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tlr5Q9JLF7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tlr5Q9JLF7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tlr5Q9JLF7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tlr5Q9JLF7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tlr5Q9JLF7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tlr5Q9JLF7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tlr5Q9JLF7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tlr5Q9JLF7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tlr5Q9JLF7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tlr5Q9JLF7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tlr5Q9JLF7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tlr5Q9JLF7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tlr5Q9JLF7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tlr5Q9JLF7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tlr5Q9JLF7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tlr5Q9JLF7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tlr5Q9JLF7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tlr5Q9JLF7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tlr5Q9JLF7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tlr5Q9JLF7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tlr5Q9JLF7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tlr5Q9JLF7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tlr5Q9JLF7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tlr5Q9JLF7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tlr5Q9JLF7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tlr5Q9JLF7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tlr5Q9JLF7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr5Q9JLF7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr5Q9JLF7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr5Q9JLF7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr5Q9JLF7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr5Q9JLF7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr5Q9JLF7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr5Q9JLF7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr5Q9JLF7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr5Q9JLF7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr5Q9JLF7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr5Q9JLF7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr5Q9JLF7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr5Q9JLF7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr5Q9JLF7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr5Q9JLF7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tlr5Q9JLF7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tlr5Q9JLF7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tlr5Q9JLF7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tlr5Q9JLF7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tlr5Q9JLF7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tlr5Q9JLF7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tlr5Q9JLF7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tlr5Q9JLF7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tlr5Q9JLF7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tlr5Q9JLF7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tlr5Q9JLF7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tlr5Q9JLF7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tlr5Q9JLF7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tlr5Q9JLF7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tlr5Q9JLF7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tlr5Q9JLF7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tlr5Q9JLF7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tlr5Q9JLF7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tlr5Q9JLF7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tlr5Q9JLF7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tlr5Q9JLF7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tlr5Q9JLF7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tlr5Q9JLF7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tlr5Q9JLF7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tlr5Q9JLF7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tlr5Q9JLF7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tlr5Q9JLF7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tlr5Q9JLF7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tlr5Q9JLF7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tlr5Q9JLF7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tlr5Q9JLF7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96 ms