Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tgm1Q9JLF6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tgm1Q9JLF6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tgm1Q9JLF6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tgm1Q9JLF6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tgm1Q9JLF6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tgm1Q9JLF6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tgm1Q9JLF6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tgm1Q9JLF6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tgm1Q9JLF6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tgm1Q9JLF6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tgm1Q9JLF6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tgm1Q9JLF6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tgm1Q9JLF6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tgm1Q9JLF6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tgm1Q9JLF6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tgm1Q9JLF6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tgm1Q9JLF6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tgm1Q9JLF6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tgm1Q9JLF6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tgm1Q9JLF6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tgm1Q9JLF6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tgm1Q9JLF6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tgm1Q9JLF6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tgm1Q9JLF6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tgm1Q9JLF6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tgm1Q9JLF6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tgm1Q9JLF6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tgm1Q9JLF6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tgm1Q9JLF6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tgm1Q9JLF6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tgm1Q9JLF6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tgm1Q9JLF6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tgm1Q9JLF6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tgm1Q9JLF6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tgm1Q9JLF6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tgm1Q9JLF6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tgm1Q9JLF6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tgm1Q9JLF6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tgm1Q9JLF6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tgm1Q9JLF6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tgm1Q9JLF6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tgm1Q9JLF6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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Tgm1Q9JLF6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tgm1Q9JLF6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tgm1Q9JLF6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tgm1Q9JLF6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tgm1Q9JLF6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tgm1Q9JLF6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tgm1Q9JLF6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tgm1Q9JLF6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tgm1Q9JLF6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tgm1Q9JLF6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tgm1Q9JLF6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tgm1Q9JLF6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tgm1Q9JLF6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tgm1Q9JLF6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tgm1Q9JLF6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tgm1Q9JLF6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tgm1Q9JLF6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tgm1Q9JLF6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tgm1Q9JLF6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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Tgm1Q9JLF6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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Tgm1Q9JLF6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tgm1Q9JLF6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tgm1Q9JLF6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tgm1Q9JLF6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tgm1Q9JLF6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tgm1Q9JLF6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tgm1Q9JLF6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tgm1Q9JLF6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tgm1Q9JLF6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tgm1Q9JLF6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tgm1Q9JLF6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tgm1Q9JLF6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tgm1Q9JLF6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tgm1Q9JLF6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tgm1Q9JLF6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tgm1Q9JLF6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tgm1Q9JLF6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tgm1Q9JLF6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tgm1Q9JLF6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tgm1Q9JLF6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tgm1Q9JLF6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tgm1Q9JLF6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tgm1Q9JLF6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tgm1Q9JLF6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tgm1Q9JLF6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tgm1Q9JLF6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tgm1Q9JLF6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tgm1Q9JLF6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tgm1Q9JLF6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms