Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Upk3aQ9JKX8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Upk3aQ9JKX8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Upk3aQ9JKX8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Upk3aQ9JKX8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Upk3aQ9JKX8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Upk3aQ9JKX8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Upk3aQ9JKX8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Upk3aQ9JKX8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Upk3aQ9JKX8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Upk3aQ9JKX8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Upk3aQ9JKX8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Upk3aQ9JKX8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Upk3aQ9JKX8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Upk3aQ9JKX8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Upk3aQ9JKX8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Upk3aQ9JKX8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Upk3aQ9JKX8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Upk3aQ9JKX8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Upk3aQ9JKX8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Upk3aQ9JKX8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Upk3aQ9JKX8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Upk3aQ9JKX8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Upk3aQ9JKX8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Upk3aQ9JKX8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Upk3aQ9JKX8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Upk3aQ9JKX8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Upk3aQ9JKX8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Upk3aQ9JKX8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Upk3aQ9JKX8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Upk3aQ9JKX8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms