Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Scamp4Q9JKV5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scamp4Q9JKV5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Scamp4Q9JKV5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Scamp4Q9JKV5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scamp4Q9JKV5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scamp4Q9JKV5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scamp4Q9JKV5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scamp4Q9JKV5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scamp4Q9JKV5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scamp4Q9JKV5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scamp4Q9JKV5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scamp4Q9JKV5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scamp4Q9JKV5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scamp4Q9JKV5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scamp4Q9JKV5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scamp4Q9JKV5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Scamp4Q9JKV5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scamp4Q9JKV5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scamp4Q9JKV5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scamp4Q9JKV5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scamp4Q9JKV5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scamp4Q9JKV5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scamp4Q9JKV5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scamp4Q9JKV5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scamp4Q9JKV5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scamp4Q9JKV5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scamp4Q9JKV5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scamp4Q9JKV5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scamp4Q9JKV5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scamp4Q9JKV5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scamp4Q9JKV5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scamp4Q9JKV5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scamp4Q9JKV5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scamp4Q9JKV5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scamp4Q9JKV5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scamp4Q9JKV5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scamp4Q9JKV5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scamp4Q9JKV5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scamp4Q9JKV5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scamp4Q9JKV5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scamp4Q9JKV5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Scamp4Q9JKV5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Scamp4Q9JKV5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scamp4Q9JKV5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scamp4Q9JKV5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scamp4Q9JKV5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Scamp4Q9JKV5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scamp4Q9JKV5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scamp4Q9JKV5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scamp4Q9JKV5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scamp4Q9JKV5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scamp4Q9JKV5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scamp4Q9JKV5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Scamp4Q9JKV5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scamp4Q9JKV5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scamp4Q9JKV5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scamp4Q9JKV5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scamp4Q9JKV5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scamp4Q9JKV5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scamp4Q9JKV5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scamp4Q9JKV5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scamp4Q9JKV5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scamp4Q9JKV5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scamp4Q9JKV5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scamp4Q9JKV5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scamp4Q9JKV5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scamp4Q9JKV5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scamp4Q9JKV5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scamp4Q9JKV5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scamp4Q9JKV5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scamp4Q9JKV5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scamp4Q9JKV5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scamp4Q9JKV5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scamp4Q9JKV5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scamp4Q9JKV5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scamp4Q9JKV5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scamp4Q9JKV5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scamp4Q9JKV5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scamp4Q9JKV5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scamp4Q9JKV5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scamp4Q9JKV5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scamp4Q9JKV5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scamp4Q9JKV5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scamp4Q9JKV5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scamp4Q9JKV5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scamp4Q9JKV5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scamp4Q9JKV5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scamp4Q9JKV5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scamp4Q9JKV5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scamp4Q9JKV5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scamp4Q9JKV5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scamp4Q9JKV5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scamp4Q9JKV5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scamp4Q9JKV5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scamp4Q9JKV5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scamp4Q9JKV5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scamp4Q9JKV5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Scamp4Q9JKV5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scamp4Q9JKV5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms