Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chrac1Q9JKP8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Chrac1Q9JKP8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chrac1Q9JKP8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chrac1Q9JKP8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chrac1Q9JKP8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chrac1Q9JKP8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chrac1Q9JKP8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chrac1Q9JKP8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chrac1Q9JKP8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chrac1Q9JKP8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chrac1Q9JKP8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chrac1Q9JKP8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chrac1Q9JKP8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chrac1Q9JKP8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chrac1Q9JKP8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chrac1Q9JKP8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chrac1Q9JKP8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chrac1Q9JKP8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chrac1Q9JKP8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chrac1Q9JKP8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chrac1Q9JKP8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Chrac1Q9JKP8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chrac1Q9JKP8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chrac1Q9JKP8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chrac1Q9JKP8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chrac1Q9JKP8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chrac1Q9JKP8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chrac1Q9JKP8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chrac1Q9JKP8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chrac1Q9JKP8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chrac1Q9JKP8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chrac1Q9JKP8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chrac1Q9JKP8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Chrac1Q9JKP8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chrac1Q9JKP8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chrac1Q9JKP8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chrac1Q9JKP8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chrac1Q9JKP8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chrac1Q9JKP8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chrac1Q9JKP8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chrac1Q9JKP8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chrac1Q9JKP8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chrac1Q9JKP8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chrac1Q9JKP8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chrac1Q9JKP8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chrac1Q9JKP8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chrac1Q9JKP8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chrac1Q9JKP8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chrac1Q9JKP8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chrac1Q9JKP8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chrac1Q9JKP8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chrac1Q9JKP8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chrac1Q9JKP8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chrac1Q9JKP8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chrac1Q9JKP8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chrac1Q9JKP8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chrac1Q9JKP8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chrac1Q9JKP8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chrac1Q9JKP8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chrac1Q9JKP8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chrac1Q9JKP8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chrac1Q9JKP8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chrac1Q9JKP8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chrac1Q9JKP8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chrac1Q9JKP8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chrac1Q9JKP8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chrac1Q9JKP8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chrac1Q9JKP8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chrac1Q9JKP8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chrac1Q9JKP8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chrac1Q9JKP8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chrac1Q9JKP8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chrac1Q9JKP8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chrac1Q9JKP8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chrac1Q9JKP8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chrac1Q9JKP8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chrac1Q9JKP8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chrac1Q9JKP8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chrac1Q9JKP8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chrac1Q9JKP8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chrac1Q9JKP8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chrac1Q9JKP8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Chrac1Q9JKP8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chrac1Q9JKP8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chrac1Q9JKP8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chrac1Q9JKP8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Chrac1Q9JKP8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Chrac1Q9JKP8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Chrac1Q9JKP8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Chrac1Q9JKP8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chrac1Q9JKP8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chrac1Q9JKP8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chrac1Q9JKP8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Chrac1Q9JKP8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chrac1Q9JKP8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chrac1Q9JKP8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chrac1Q9JKP8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chrac1Q9JKP8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chrac1Q9JKP8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms