Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pard6bQ9JK83 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pard6bQ9JK83 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pard6bQ9JK83 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pard6bQ9JK83 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pard6bQ9JK83 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pard6bQ9JK83 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pard6bQ9JK83 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pard6bQ9JK83 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pard6bQ9JK83 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pard6bQ9JK83 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pard6bQ9JK83 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pard6bQ9JK83 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Pard6bQ9JK83 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Pard6bQ9JK83 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pard6bQ9JK83 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pard6bQ9JK83 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pard6bQ9JK83 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Pard6bQ9JK83 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pard6bQ9JK83 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pard6bQ9JK83 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pard6bQ9JK83 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pard6bQ9JK83 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pard6bQ9JK83 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Pard6bQ9JK83 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pard6bQ9JK83 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pard6bQ9JK83 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pard6bQ9JK83 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pard6bQ9JK83 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pard6bQ9JK83 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pard6bQ9JK83 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pard6bQ9JK83 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pard6bQ9JK83 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pard6bQ9JK83 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pard6bQ9JK83 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pard6bQ9JK83 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pard6bQ9JK83 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Pard6bQ9JK83 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pard6bQ9JK83 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pard6bQ9JK83 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pard6bQ9JK83 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pard6bQ9JK83 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pard6bQ9JK83 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pard6bQ9JK83 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pard6bQ9JK83 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pard6bQ9JK83 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pard6bQ9JK83 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pard6bQ9JK83 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pard6bQ9JK83 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pard6bQ9JK83 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pard6bQ9JK83 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pard6bQ9JK83 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pard6bQ9JK83 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Pard6bQ9JK83 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pard6bQ9JK83 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pard6bQ9JK83 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pard6bQ9JK83 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pard6bQ9JK83 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pard6bQ9JK83 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pard6bQ9JK83 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pard6bQ9JK83 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pard6bQ9JK83 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pard6bQ9JK83 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pard6bQ9JK83 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Pard6bQ9JK83 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Pard6bQ9JK83 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pard6bQ9JK83 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pard6bQ9JK83 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pard6bQ9JK83 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pard6bQ9JK83 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pard6bQ9JK83 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pard6bQ9JK83 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pard6bQ9JK83 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pard6bQ9JK83 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pard6bQ9JK83 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pard6bQ9JK83 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pard6bQ9JK83 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pard6bQ9JK83 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pard6bQ9JK83 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pard6bQ9JK83 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pard6bQ9JK83 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pard6bQ9JK83 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pard6bQ9JK83 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pard6bQ9JK83 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pard6bQ9JK83 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pard6bQ9JK83 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pard6bQ9JK83 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pard6bQ9JK83 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pard6bQ9JK83 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pard6bQ9JK83 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pard6bQ9JK83 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pard6bQ9JK83 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pard6bQ9JK83 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pard6bQ9JK83 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pard6bQ9JK83 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pard6bQ9JK83 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pard6bQ9JK83 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pard6bQ9JK83 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pard6bQ9JK83 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pard6bQ9JK83 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms