Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnga3Q9JJZ8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnga3Q9JJZ8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnga3Q9JJZ8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnga3Q9JJZ8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnga3Q9JJZ8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnga3Q9JJZ8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnga3Q9JJZ8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnga3Q9JJZ8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnga3Q9JJZ8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnga3Q9JJZ8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnga3Q9JJZ8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnga3Q9JJZ8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnga3Q9JJZ8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnga3Q9JJZ8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnga3Q9JJZ8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnga3Q9JJZ8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnga3Q9JJZ8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnga3Q9JJZ8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnga3Q9JJZ8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnga3Q9JJZ8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cnga3Q9JJZ8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cnga3Q9JJZ8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnga3Q9JJZ8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnga3Q9JJZ8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnga3Q9JJZ8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnga3Q9JJZ8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnga3Q9JJZ8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnga3Q9JJZ8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnga3Q9JJZ8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnga3Q9JJZ8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnga3Q9JJZ8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnga3Q9JJZ8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnga3Q9JJZ8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnga3Q9JJZ8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnga3Q9JJZ8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnga3Q9JJZ8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnga3Q9JJZ8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnga3Q9JJZ8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnga3Q9JJZ8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnga3Q9JJZ8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnga3Q9JJZ8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnga3Q9JJZ8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnga3Q9JJZ8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnga3Q9JJZ8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnga3Q9JJZ8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnga3Q9JJZ8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnga3Q9JJZ8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnga3Q9JJZ8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnga3Q9JJZ8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnga3Q9JJZ8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnga3Q9JJZ8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnga3Q9JJZ8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnga3Q9JJZ8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnga3Q9JJZ8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnga3Q9JJZ8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cnga3Q9JJZ8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cnga3Q9JJZ8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cnga3Q9JJZ8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cnga3Q9JJZ8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnga3Q9JJZ8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnga3Q9JJZ8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnga3Q9JJZ8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnga3Q9JJZ8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnga3Q9JJZ8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnga3Q9JJZ8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnga3Q9JJZ8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnga3Q9JJZ8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnga3Q9JJZ8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnga3Q9JJZ8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnga3Q9JJZ8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnga3Q9JJZ8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnga3Q9JJZ8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnga3Q9JJZ8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnga3Q9JJZ8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnga3Q9JJZ8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnga3Q9JJZ8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnga3Q9JJZ8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnga3Q9JJZ8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnga3Q9JJZ8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnga3Q9JJZ8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnga3Q9JJZ8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnga3Q9JJZ8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnga3Q9JJZ8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnga3Q9JJZ8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnga3Q9JJZ8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnga3Q9JJZ8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnga3Q9JJZ8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnga3Q9JJZ8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnga3Q9JJZ8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnga3Q9JJZ8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnga3Q9JJZ8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnga3Q9JJZ8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnga3Q9JJZ8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnga3Q9JJZ8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnga3Q9JJZ8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnga3Q9JJZ8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnga3Q9JJZ8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnga3Q9JJZ8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnga3Q9JJZ8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
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