Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR9

Nrip3, Nuclear receptor-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip3Q9JJR9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nrip3Q9JJR9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nrip3Q9JJR9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nrip3Q9JJR9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nrip3Q9JJR9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nrip3Q9JJR9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Nrip3Q9JJR9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nrip3Q9JJR9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nrip3Q9JJR9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nrip3Q9JJR9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nrip3Q9JJR9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nrip3Q9JJR9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nrip3Q9JJR9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nrip3Q9JJR9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nrip3Q9JJR9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nrip3Q9JJR9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nrip3Q9JJR9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nrip3Q9JJR9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nrip3Q9JJR9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nrip3Q9JJR9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nrip3Q9JJR9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nrip3Q9JJR9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nrip3Q9JJR9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nrip3Q9JJR9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nrip3Q9JJR9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nrip3Q9JJR9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nrip3Q9JJR9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Nrip3Q9JJR9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nrip3Q9JJR9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nrip3Q9JJR9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nrip3Q9JJR9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nrip3Q9JJR9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nrip3Q9JJR9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nrip3Q9JJR9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nrip3Q9JJR9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nrip3Q9JJR9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nrip3Q9JJR9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Nrip3Q9JJR9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nrip3Q9JJR9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nrip3Q9JJR9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nrip3Q9JJR9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nrip3Q9JJR9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nrip3Q9JJR9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nrip3Q9JJR9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nrip3Q9JJR9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nrip3Q9JJR9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nrip3Q9JJR9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nrip3Q9JJR9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nrip3Q9JJR9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nrip3Q9JJR9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nrip3Q9JJR9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nrip3Q9JJR9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nrip3Q9JJR9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nrip3Q9JJR9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nrip3Q9JJR9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nrip3Q9JJR9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nrip3Q9JJR9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nrip3Q9JJR9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Nrip3Q9JJR9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nrip3Q9JJR9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nrip3Q9JJR9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nrip3Q9JJR9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nrip3Q9JJR9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms