Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJG6

Tmem47, Transmembrane protein 47, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem47Q9JJG6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmem47Q9JJG6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmem47Q9JJG6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmem47Q9JJG6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmem47Q9JJG6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmem47Q9JJG6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmem47Q9JJG6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmem47Q9JJG6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmem47Q9JJG6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmem47Q9JJG6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmem47Q9JJG6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmem47Q9JJG6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmem47Q9JJG6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmem47Q9JJG6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmem47Q9JJG6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmem47Q9JJG6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmem47Q9JJG6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmem47Q9JJG6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmem47Q9JJG6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmem47Q9JJG6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmem47Q9JJG6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmem47Q9JJG6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmem47Q9JJG6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmem47Q9JJG6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmem47Q9JJG6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmem47Q9JJG6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmem47Q9JJG6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmem47Q9JJG6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmem47Q9JJG6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmem47Q9JJG6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmem47Q9JJG6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmem47Q9JJG6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmem47Q9JJG6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmem47Q9JJG6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmem47Q9JJG6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmem47Q9JJG6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmem47Q9JJG6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmem47Q9JJG6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmem47Q9JJG6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmem47Q9JJG6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmem47Q9JJG6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmem47Q9JJG6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmem47Q9JJG6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmem47Q9JJG6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmem47Q9JJG6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmem47Q9JJG6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmem47Q9JJG6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmem47Q9JJG6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmem47Q9JJG6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmem47Q9JJG6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmem47Q9JJG6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmem47Q9JJG6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmem47Q9JJG6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmem47Q9JJG6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmem47Q9JJG6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmem47Q9JJG6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmem47Q9JJG6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmem47Q9JJG6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmem47Q9JJG6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmem47Q9JJG6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmem47Q9JJG6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmem47Q9JJG6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmem47Q9JJG6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmem47Q9JJG6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmem47Q9JJG6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmem47Q9JJG6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tmem47Q9JJG6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tmem47Q9JJG6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmem47Q9JJG6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmem47Q9JJG6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmem47Q9JJG6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmem47Q9JJG6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmem47Q9JJG6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmem47Q9JJG6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmem47Q9JJG6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmem47Q9JJG6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmem47Q9JJG6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmem47Q9JJG6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmem47Q9JJG6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmem47Q9JJG6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmem47Q9JJG6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmem47Q9JJG6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmem47Q9JJG6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmem47Q9JJG6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmem47Q9JJG6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmem47Q9JJG6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmem47Q9JJG6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmem47Q9JJG6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmem47Q9JJG6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmem47Q9JJG6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmem47Q9JJG6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmem47Q9JJG6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmem47Q9JJG6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmem47Q9JJG6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmem47Q9JJG6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmem47Q9JJG6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmem47Q9JJG6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmem47Q9JJG6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmem47Q9JJG6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmem47Q9JJG6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms