Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Efcc1Q9JJF6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Efcc1Q9JJF6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Efcc1Q9JJF6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Efcc1Q9JJF6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Efcc1Q9JJF6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Efcc1Q9JJF6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Efcc1Q9JJF6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Efcc1Q9JJF6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Efcc1Q9JJF6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Efcc1Q9JJF6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Efcc1Q9JJF6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Efcc1Q9JJF6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Efcc1Q9JJF6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Efcc1Q9JJF6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Efcc1Q9JJF6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Efcc1Q9JJF6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Efcc1Q9JJF6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Efcc1Q9JJF6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Efcc1Q9JJF6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Efcc1Q9JJF6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Efcc1Q9JJF6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Efcc1Q9JJF6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Efcc1Q9JJF6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Efcc1Q9JJF6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Efcc1Q9JJF6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Efcc1Q9JJF6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Efcc1Q9JJF6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Efcc1Q9JJF6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Efcc1Q9JJF6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Efcc1Q9JJF6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Efcc1Q9JJF6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Efcc1Q9JJF6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Efcc1Q9JJF6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Efcc1Q9JJF6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Efcc1Q9JJF6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Efcc1Q9JJF6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Efcc1Q9JJF6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Efcc1Q9JJF6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Efcc1Q9JJF6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Efcc1Q9JJF6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Efcc1Q9JJF6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Efcc1Q9JJF6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Efcc1Q9JJF6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Efcc1Q9JJF6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Efcc1Q9JJF6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Efcc1Q9JJF6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Efcc1Q9JJF6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Efcc1Q9JJF6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Efcc1Q9JJF6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Efcc1Q9JJF6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Efcc1Q9JJF6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Efcc1Q9JJF6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Efcc1Q9JJF6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Efcc1Q9JJF6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Efcc1Q9JJF6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Efcc1Q9JJF6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Efcc1Q9JJF6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Efcc1Q9JJF6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Efcc1Q9JJF6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Efcc1Q9JJF6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Efcc1Q9JJF6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Efcc1Q9JJF6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Efcc1Q9JJF6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Efcc1Q9JJF6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Efcc1Q9JJF6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Efcc1Q9JJF6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Efcc1Q9JJF6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Efcc1Q9JJF6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Efcc1Q9JJF6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Efcc1Q9JJF6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Efcc1Q9JJF6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Efcc1Q9JJF6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Efcc1Q9JJF6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Efcc1Q9JJF6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Efcc1Q9JJF6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Efcc1Q9JJF6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Efcc1Q9JJF6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Efcc1Q9JJF6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Efcc1Q9JJF6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Efcc1Q9JJF6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Efcc1Q9JJF6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Efcc1Q9JJF6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Efcc1Q9JJF6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Efcc1Q9JJF6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Efcc1Q9JJF6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Efcc1Q9JJF6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Efcc1Q9JJF6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Efcc1Q9JJF6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Efcc1Q9JJF6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Efcc1Q9JJF6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Efcc1Q9JJF6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Efcc1Q9JJF6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Efcc1Q9JJF6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Efcc1Q9JJF6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Efcc1Q9JJF6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Efcc1Q9JJF6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Efcc1Q9JJF6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Efcc1Q9JJF6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Efcc1Q9JJF6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms