Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RabggtaQ9JHK4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RabggtaQ9JHK4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RabggtaQ9JHK4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RabggtaQ9JHK4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RabggtaQ9JHK4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RabggtaQ9JHK4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RabggtaQ9JHK4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RabggtaQ9JHK4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RabggtaQ9JHK4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RabggtaQ9JHK4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RabggtaQ9JHK4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RabggtaQ9JHK4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RabggtaQ9JHK4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RabggtaQ9JHK4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RabggtaQ9JHK4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RabggtaQ9JHK4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RabggtaQ9JHK4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RabggtaQ9JHK4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RabggtaQ9JHK4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RabggtaQ9JHK4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RabggtaQ9JHK4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RabggtaQ9JHK4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RabggtaQ9JHK4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RabggtaQ9JHK4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RabggtaQ9JHK4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RabggtaQ9JHK4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RabggtaQ9JHK4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RabggtaQ9JHK4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RabggtaQ9JHK4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RabggtaQ9JHK4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RabggtaQ9JHK4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RabggtaQ9JHK4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RabggtaQ9JHK4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RabggtaQ9JHK4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RabggtaQ9JHK4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RabggtaQ9JHK4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RabggtaQ9JHK4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RabggtaQ9JHK4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RabggtaQ9JHK4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RabggtaQ9JHK4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RabggtaQ9JHK4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RabggtaQ9JHK4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RabggtaQ9JHK4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RabggtaQ9JHK4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RabggtaQ9JHK4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RabggtaQ9JHK4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RabggtaQ9JHK4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RabggtaQ9JHK4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RabggtaQ9JHK4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RabggtaQ9JHK4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RabggtaQ9JHK4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RabggtaQ9JHK4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RabggtaQ9JHK4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RabggtaQ9JHK4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RabggtaQ9JHK4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RabggtaQ9JHK4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RabggtaQ9JHK4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RabggtaQ9JHK4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RabggtaQ9JHK4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RabggtaQ9JHK4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RabggtaQ9JHK4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RabggtaQ9JHK4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RabggtaQ9JHK4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RabggtaQ9JHK4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RabggtaQ9JHK4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RabggtaQ9JHK4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RabggtaQ9JHK4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RabggtaQ9JHK4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RabggtaQ9JHK4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RabggtaQ9JHK4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RabggtaQ9JHK4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RabggtaQ9JHK4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RabggtaQ9JHK4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RabggtaQ9JHK4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RabggtaQ9JHK4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RabggtaQ9JHK4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RabggtaQ9JHK4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RabggtaQ9JHK4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RabggtaQ9JHK4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RabggtaQ9JHK4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RabggtaQ9JHK4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RabggtaQ9JHK4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RabggtaQ9JHK4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RabggtaQ9JHK4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RabggtaQ9JHK4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RabggtaQ9JHK4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RabggtaQ9JHK4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RabggtaQ9JHK4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RabggtaQ9JHK4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RabggtaQ9JHK4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RabggtaQ9JHK4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RabggtaQ9JHK4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RabggtaQ9JHK4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RabggtaQ9JHK4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RabggtaQ9JHK4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RabggtaQ9JHK4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RabggtaQ9JHK4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RabggtaQ9JHK4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RabggtaQ9JHK4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
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