Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET37

Slc5a4a, Solute carrier family 5 member 4A, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4aQ9ET37 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc5a4aQ9ET37 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc5a4aQ9ET37 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc5a4aQ9ET37 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc5a4aQ9ET37 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc5a4aQ9ET37 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc5a4aQ9ET37 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc5a4aQ9ET37 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc5a4aQ9ET37 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc5a4aQ9ET37 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc5a4aQ9ET37 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc5a4aQ9ET37 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc5a4aQ9ET37 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc5a4aQ9ET37 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc5a4aQ9ET37 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc5a4aQ9ET37 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc5a4aQ9ET37 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc5a4aQ9ET37 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc5a4aQ9ET37 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc5a4aQ9ET37 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc5a4aQ9ET37 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slc5a4aQ9ET37 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slc5a4aQ9ET37 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc5a4aQ9ET37 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slc5a4aQ9ET37 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slc5a4aQ9ET37 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc5a4aQ9ET37 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc5a4aQ9ET37 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc5a4aQ9ET37 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc5a4aQ9ET37 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc5a4aQ9ET37 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc5a4aQ9ET37 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc5a4aQ9ET37 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms