Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG4

Tmem27, Collectrin, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem27Q9ESG4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem27Q9ESG4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms