Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQG9

Col4a3bp, Collagen type IV alpha-3-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3bpQ9EQG9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col4a3bpQ9EQG9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col4a3bpQ9EQG9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col4a3bpQ9EQG9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col4a3bpQ9EQG9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col4a3bpQ9EQG9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col4a3bpQ9EQG9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col4a3bpQ9EQG9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col4a3bpQ9EQG9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col4a3bpQ9EQG9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col4a3bpQ9EQG9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col4a3bpQ9EQG9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Col4a3bpQ9EQG9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col4a3bpQ9EQG9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col4a3bpQ9EQG9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col4a3bpQ9EQG9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col4a3bpQ9EQG9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col4a3bpQ9EQG9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col4a3bpQ9EQG9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col4a3bpQ9EQG9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col4a3bpQ9EQG9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col4a3bpQ9EQG9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col4a3bpQ9EQG9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col4a3bpQ9EQG9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col4a3bpQ9EQG9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Col4a3bpQ9EQG9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col4a3bpQ9EQG9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col4a3bpQ9EQG9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col4a3bpQ9EQG9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col4a3bpQ9EQG9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col4a3bpQ9EQG9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col4a3bpQ9EQG9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col4a3bpQ9EQG9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col4a3bpQ9EQG9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col4a3bpQ9EQG9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col4a3bpQ9EQG9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col4a3bpQ9EQG9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col4a3bpQ9EQG9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col4a3bpQ9EQG9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col4a3bpQ9EQG9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col4a3bpQ9EQG9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col4a3bpQ9EQG9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col4a3bpQ9EQG9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col4a3bpQ9EQG9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col4a3bpQ9EQG9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col4a3bpQ9EQG9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col4a3bpQ9EQG9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Col4a3bpQ9EQG9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col4a3bpQ9EQG9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col4a3bpQ9EQG9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col4a3bpQ9EQG9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col4a3bpQ9EQG9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col4a3bpQ9EQG9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col4a3bpQ9EQG9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Col4a3bpQ9EQG9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col4a3bpQ9EQG9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col4a3bpQ9EQG9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col4a3bpQ9EQG9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col4a3bpQ9EQG9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Col4a3bpQ9EQG9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col4a3bpQ9EQG9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Col4a3bpQ9EQG9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Col4a3bpQ9EQG9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Col4a3bpQ9EQG9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Col4a3bpQ9EQG9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Col4a3bpQ9EQG9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col4a3bpQ9EQG9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col4a3bpQ9EQG9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col4a3bpQ9EQG9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col4a3bpQ9EQG9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col4a3bpQ9EQG9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col4a3bpQ9EQG9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col4a3bpQ9EQG9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col4a3bpQ9EQG9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col4a3bpQ9EQG9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col4a3bpQ9EQG9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col4a3bpQ9EQG9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col4a3bpQ9EQG9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col4a3bpQ9EQG9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col4a3bpQ9EQG9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col4a3bpQ9EQG9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col4a3bpQ9EQG9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col4a3bpQ9EQG9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Col4a3bpQ9EQG9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Col4a3bpQ9EQG9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col4a3bpQ9EQG9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col4a3bpQ9EQG9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col4a3bpQ9EQG9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col4a3bpQ9EQG9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col4a3bpQ9EQG9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col4a3bpQ9EQG9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Col4a3bpQ9EQG9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Col4a3bpQ9EQG9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Col4a3bpQ9EQG9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col4a3bpQ9EQG9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Col4a3bpQ9EQG9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col4a3bpQ9EQG9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col4a3bpQ9EQG9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col4a3bpQ9EQG9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.1 ms