Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Rpgrip1Q9EPQ2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Rpgrip1Q9EPQ2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Rpgrip1Q9EPQ2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Rpgrip1Q9EPQ2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Rpgrip1Q9EPQ2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Rpgrip1Q9EPQ2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Rpgrip1Q9EPQ2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Rpgrip1Q9EPQ2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Rpgrip1Q9EPQ2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Rpgrip1Q9EPQ2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Rpgrip1Q9EPQ2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms