Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clstn1Q9EPL2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clstn1Q9EPL2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clstn1Q9EPL2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clstn1Q9EPL2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Clstn1Q9EPL2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clstn1Q9EPL2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clstn1Q9EPL2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clstn1Q9EPL2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clstn1Q9EPL2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clstn1Q9EPL2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clstn1Q9EPL2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clstn1Q9EPL2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Clstn1Q9EPL2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clstn1Q9EPL2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clstn1Q9EPL2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clstn1Q9EPL2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clstn1Q9EPL2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clstn1Q9EPL2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clstn1Q9EPL2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clstn1Q9EPL2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clstn1Q9EPL2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clstn1Q9EPL2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clstn1Q9EPL2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clstn1Q9EPL2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Clstn1Q9EPL2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clstn1Q9EPL2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clstn1Q9EPL2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clstn1Q9EPL2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clstn1Q9EPL2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clstn1Q9EPL2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clstn1Q9EPL2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clstn1Q9EPL2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clstn1Q9EPL2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clstn1Q9EPL2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clstn1Q9EPL2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clstn1Q9EPL2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clstn1Q9EPL2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clstn1Q9EPL2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Clstn1Q9EPL2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clstn1Q9EPL2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Clstn1Q9EPL2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clstn1Q9EPL2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clstn1Q9EPL2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Clstn1Q9EPL2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Clstn1Q9EPL2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Clstn1Q9EPL2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Clstn1Q9EPL2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Clstn1Q9EPL2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Clstn1Q9EPL2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clstn1Q9EPL2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clstn1Q9EPL2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clstn1Q9EPL2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clstn1Q9EPL2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clstn1Q9EPL2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clstn1Q9EPL2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clstn1Q9EPL2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clstn1Q9EPL2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clstn1Q9EPL2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clstn1Q9EPL2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clstn1Q9EPL2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clstn1Q9EPL2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clstn1Q9EPL2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clstn1Q9EPL2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clstn1Q9EPL2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Clstn1Q9EPL2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clstn1Q9EPL2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clstn1Q9EPL2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clstn1Q9EPL2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clstn1Q9EPL2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clstn1Q9EPL2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clstn1Q9EPL2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clstn1Q9EPL2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clstn1Q9EPL2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clstn1Q9EPL2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clstn1Q9EPL2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clstn1Q9EPL2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clstn1Q9EPL2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clstn1Q9EPL2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clstn1Q9EPL2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clstn1Q9EPL2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clstn1Q9EPL2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clstn1Q9EPL2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clstn1Q9EPL2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clstn1Q9EPL2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clstn1Q9EPL2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clstn1Q9EPL2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clstn1Q9EPL2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clstn1Q9EPL2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clstn1Q9EPL2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Clstn1Q9EPL2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Clstn1Q9EPL2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clstn1Q9EPL2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clstn1Q9EPL2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clstn1Q9EPL2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clstn1Q9EPL2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clstn1Q9EPL2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clstn1Q9EPL2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Clstn1Q9EPL2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clstn1Q9EPL2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms