Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBR7

Ppp1r12a, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 12A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r12aQ9DBR7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppp1r12aQ9DBR7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppp1r12aQ9DBR7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppp1r12aQ9DBR7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppp1r12aQ9DBR7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppp1r12aQ9DBR7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppp1r12aQ9DBR7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppp1r12aQ9DBR7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppp1r12aQ9DBR7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppp1r12aQ9DBR7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppp1r12aQ9DBR7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppp1r12aQ9DBR7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppp1r12aQ9DBR7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppp1r12aQ9DBR7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppp1r12aQ9DBR7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppp1r12aQ9DBR7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppp1r12aQ9DBR7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppp1r12aQ9DBR7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppp1r12aQ9DBR7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppp1r12aQ9DBR7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppp1r12aQ9DBR7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppp1r12aQ9DBR7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppp1r12aQ9DBR7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppp1r12aQ9DBR7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppp1r12aQ9DBR7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppp1r12aQ9DBR7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppp1r12aQ9DBR7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppp1r12aQ9DBR7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppp1r12aQ9DBR7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppp1r12aQ9DBR7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppp1r12aQ9DBR7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppp1r12aQ9DBR7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppp1r12aQ9DBR7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppp1r12aQ9DBR7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppp1r12aQ9DBR7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppp1r12aQ9DBR7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppp1r12aQ9DBR7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppp1r12aQ9DBR7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ppp1r12aQ9DBR7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ppp1r12aQ9DBR7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ppp1r12aQ9DBR7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppp1r12aQ9DBR7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppp1r12aQ9DBR7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppp1r12aQ9DBR7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppp1r12aQ9DBR7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppp1r12aQ9DBR7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppp1r12aQ9DBR7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppp1r12aQ9DBR7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppp1r12aQ9DBR7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppp1r12aQ9DBR7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppp1r12aQ9DBR7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppp1r12aQ9DBR7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppp1r12aQ9DBR7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppp1r12aQ9DBR7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppp1r12aQ9DBR7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppp1r12aQ9DBR7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppp1r12aQ9DBR7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppp1r12aQ9DBR7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppp1r12aQ9DBR7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppp1r12aQ9DBR7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppp1r12aQ9DBR7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppp1r12aQ9DBR7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppp1r12aQ9DBR7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppp1r12aQ9DBR7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppp1r12aQ9DBR7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppp1r12aQ9DBR7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppp1r12aQ9DBR7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppp1r12aQ9DBR7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppp1r12aQ9DBR7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppp1r12aQ9DBR7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppp1r12aQ9DBR7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppp1r12aQ9DBR7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppp1r12aQ9DBR7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppp1r12aQ9DBR7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppp1r12aQ9DBR7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppp1r12aQ9DBR7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppp1r12aQ9DBR7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppp1r12aQ9DBR7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppp1r12aQ9DBR7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppp1r12aQ9DBR7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppp1r12aQ9DBR7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppp1r12aQ9DBR7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppp1r12aQ9DBR7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppp1r12aQ9DBR7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppp1r12aQ9DBR7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppp1r12aQ9DBR7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppp1r12aQ9DBR7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppp1r12aQ9DBR7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppp1r12aQ9DBR7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ppp1r12aQ9DBR7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ppp1r12aQ9DBR7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppp1r12aQ9DBR7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppp1r12aQ9DBR7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppp1r12aQ9DBR7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppp1r12aQ9DBR7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppp1r12aQ9DBR7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppp1r12aQ9DBR7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppp1r12aQ9DBR7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppp1r12aQ9DBR7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppp1r12aQ9DBR7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms