Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC3

Cmtr1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtr1Q9DBC3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cmtr1Q9DBC3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cmtr1Q9DBC3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cmtr1Q9DBC3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cmtr1Q9DBC3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cmtr1Q9DBC3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cmtr1Q9DBC3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cmtr1Q9DBC3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cmtr1Q9DBC3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cmtr1Q9DBC3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cmtr1Q9DBC3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cmtr1Q9DBC3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cmtr1Q9DBC3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cmtr1Q9DBC3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cmtr1Q9DBC3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cmtr1Q9DBC3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cmtr1Q9DBC3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cmtr1Q9DBC3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cmtr1Q9DBC3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cmtr1Q9DBC3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cmtr1Q9DBC3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cmtr1Q9DBC3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cmtr1Q9DBC3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cmtr1Q9DBC3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cmtr1Q9DBC3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cmtr1Q9DBC3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cmtr1Q9DBC3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cmtr1Q9DBC3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cmtr1Q9DBC3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cmtr1Q9DBC3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cmtr1Q9DBC3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cmtr1Q9DBC3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cmtr1Q9DBC3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cmtr1Q9DBC3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cmtr1Q9DBC3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cmtr1Q9DBC3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cmtr1Q9DBC3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cmtr1Q9DBC3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cmtr1Q9DBC3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cmtr1Q9DBC3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cmtr1Q9DBC3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cmtr1Q9DBC3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cmtr1Q9DBC3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cmtr1Q9DBC3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cmtr1Q9DBC3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cmtr1Q9DBC3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cmtr1Q9DBC3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cmtr1Q9DBC3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cmtr1Q9DBC3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cmtr1Q9DBC3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cmtr1Q9DBC3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cmtr1Q9DBC3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cmtr1Q9DBC3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cmtr1Q9DBC3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cmtr1Q9DBC3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cmtr1Q9DBC3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cmtr1Q9DBC3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cmtr1Q9DBC3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cmtr1Q9DBC3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cmtr1Q9DBC3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cmtr1Q9DBC3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cmtr1Q9DBC3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cmtr1Q9DBC3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cmtr1Q9DBC3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cmtr1Q9DBC3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cmtr1Q9DBC3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cmtr1Q9DBC3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cmtr1Q9DBC3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cmtr1Q9DBC3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cmtr1Q9DBC3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cmtr1Q9DBC3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cmtr1Q9DBC3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cmtr1Q9DBC3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cmtr1Q9DBC3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cmtr1Q9DBC3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cmtr1Q9DBC3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cmtr1Q9DBC3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cmtr1Q9DBC3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cmtr1Q9DBC3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cmtr1Q9DBC3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cmtr1Q9DBC3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cmtr1Q9DBC3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cmtr1Q9DBC3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cmtr1Q9DBC3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cmtr1Q9DBC3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cmtr1Q9DBC3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cmtr1Q9DBC3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cmtr1Q9DBC3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cmtr1Q9DBC3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cmtr1Q9DBC3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cmtr1Q9DBC3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cmtr1Q9DBC3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Cmtr1Q9DBC3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cmtr1Q9DBC3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cmtr1Q9DBC3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cmtr1Q9DBC3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cmtr1Q9DBC3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cmtr1Q9DBC3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cmtr1Q9DBC3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cmtr1Q9DBC3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms