Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBA6

Tysnd1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tysnd1Q9DBA6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tysnd1Q9DBA6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tysnd1Q9DBA6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tysnd1Q9DBA6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tysnd1Q9DBA6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tysnd1Q9DBA6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tysnd1Q9DBA6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tysnd1Q9DBA6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tysnd1Q9DBA6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tysnd1Q9DBA6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tysnd1Q9DBA6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tysnd1Q9DBA6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tysnd1Q9DBA6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tysnd1Q9DBA6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tysnd1Q9DBA6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tysnd1Q9DBA6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tysnd1Q9DBA6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tysnd1Q9DBA6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tysnd1Q9DBA6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tysnd1Q9DBA6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tysnd1Q9DBA6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Tysnd1Q9DBA6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tysnd1Q9DBA6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tysnd1Q9DBA6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tysnd1Q9DBA6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tysnd1Q9DBA6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tysnd1Q9DBA6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tysnd1Q9DBA6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tysnd1Q9DBA6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tysnd1Q9DBA6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tysnd1Q9DBA6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tysnd1Q9DBA6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tysnd1Q9DBA6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tysnd1Q9DBA6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tysnd1Q9DBA6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tysnd1Q9DBA6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tysnd1Q9DBA6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tysnd1Q9DBA6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Tysnd1Q9DBA6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tysnd1Q9DBA6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tysnd1Q9DBA6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tysnd1Q9DBA6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tysnd1Q9DBA6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tysnd1Q9DBA6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tysnd1Q9DBA6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tysnd1Q9DBA6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tysnd1Q9DBA6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tysnd1Q9DBA6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tysnd1Q9DBA6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tysnd1Q9DBA6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tysnd1Q9DBA6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tysnd1Q9DBA6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tysnd1Q9DBA6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tysnd1Q9DBA6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tysnd1Q9DBA6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tysnd1Q9DBA6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tysnd1Q9DBA6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tysnd1Q9DBA6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tysnd1Q9DBA6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tysnd1Q9DBA6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tysnd1Q9DBA6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tysnd1Q9DBA6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tysnd1Q9DBA6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tysnd1Q9DBA6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tysnd1Q9DBA6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tysnd1Q9DBA6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tysnd1Q9DBA6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tysnd1Q9DBA6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tysnd1Q9DBA6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tysnd1Q9DBA6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tysnd1Q9DBA6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tysnd1Q9DBA6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tysnd1Q9DBA6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tysnd1Q9DBA6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tysnd1Q9DBA6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tysnd1Q9DBA6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tysnd1Q9DBA6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tysnd1Q9DBA6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Tysnd1Q9DBA6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tysnd1Q9DBA6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tysnd1Q9DBA6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tysnd1Q9DBA6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tysnd1Q9DBA6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tysnd1Q9DBA6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tysnd1Q9DBA6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tysnd1Q9DBA6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tysnd1Q9DBA6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tysnd1Q9DBA6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tysnd1Q9DBA6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tysnd1Q9DBA6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tysnd1Q9DBA6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tysnd1Q9DBA6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tysnd1Q9DBA6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tysnd1Q9DBA6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tysnd1Q9DBA6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tysnd1Q9DBA6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tysnd1Q9DBA6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tysnd1Q9DBA6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tysnd1Q9DBA6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tysnd1Q9DBA6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms