Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL3

Ccdc54, Coiled-coil domain-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc54Q9DAL3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc54Q9DAL3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc54Q9DAL3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc54Q9DAL3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc54Q9DAL3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc54Q9DAL3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc54Q9DAL3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc54Q9DAL3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc54Q9DAL3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc54Q9DAL3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc54Q9DAL3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc54Q9DAL3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc54Q9DAL3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc54Q9DAL3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc54Q9DAL3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc54Q9DAL3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc54Q9DAL3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc54Q9DAL3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc54Q9DAL3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc54Q9DAL3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc54Q9DAL3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc54Q9DAL3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc54Q9DAL3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc54Q9DAL3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc54Q9DAL3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc54Q9DAL3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc54Q9DAL3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc54Q9DAL3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc54Q9DAL3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc54Q9DAL3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc54Q9DAL3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc54Q9DAL3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc54Q9DAL3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc54Q9DAL3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc54Q9DAL3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc54Q9DAL3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc54Q9DAL3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc54Q9DAL3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc54Q9DAL3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc54Q9DAL3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc54Q9DAL3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc54Q9DAL3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc54Q9DAL3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc54Q9DAL3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc54Q9DAL3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc54Q9DAL3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc54Q9DAL3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc54Q9DAL3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc54Q9DAL3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc54Q9DAL3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc54Q9DAL3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc54Q9DAL3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc54Q9DAL3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc54Q9DAL3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc54Q9DAL3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc54Q9DAL3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc54Q9DAL3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc54Q9DAL3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc54Q9DAL3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc54Q9DAL3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc54Q9DAL3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc54Q9DAL3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc54Q9DAL3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc54Q9DAL3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc54Q9DAL3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc54Q9DAL3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc54Q9DAL3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc54Q9DAL3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc54Q9DAL3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc54Q9DAL3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc54Q9DAL3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc54Q9DAL3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc54Q9DAL3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc54Q9DAL3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc54Q9DAL3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc54Q9DAL3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc54Q9DAL3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc54Q9DAL3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc54Q9DAL3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc54Q9DAL3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc54Q9DAL3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc54Q9DAL3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc54Q9DAL3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc54Q9DAL3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc54Q9DAL3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc54Q9DAL3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc54Q9DAL3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc54Q9DAL3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc54Q9DAL3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc54Q9DAL3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc54Q9DAL3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc54Q9DAL3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc54Q9DAL3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc54Q9DAL3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc54Q9DAL3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc54Q9DAL3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc54Q9DAL3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc54Q9DAL3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc54Q9DAL3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc54Q9DAL3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms