Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc89Q9DA73 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc89Q9DA73 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc89Q9DA73 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc89Q9DA73 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc89Q9DA73 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc89Q9DA73 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc89Q9DA73 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc89Q9DA73 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc89Q9DA73 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc89Q9DA73 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc89Q9DA73 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc89Q9DA73 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc89Q9DA73 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc89Q9DA73 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc89Q9DA73 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc89Q9DA73 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc89Q9DA73 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc89Q9DA73 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc89Q9DA73 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc89Q9DA73 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc89Q9DA73 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc89Q9DA73 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc89Q9DA73 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc89Q9DA73 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc89Q9DA73 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc89Q9DA73 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc89Q9DA73 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc89Q9DA73 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc89Q9DA73 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc89Q9DA73 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc89Q9DA73 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc89Q9DA73 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc89Q9DA73 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc89Q9DA73 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc89Q9DA73 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc89Q9DA73 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc89Q9DA73 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc89Q9DA73 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc89Q9DA73 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc89Q9DA73 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc89Q9DA73 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc89Q9DA73 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc89Q9DA73 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc89Q9DA73 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc89Q9DA73 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc89Q9DA73 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc89Q9DA73 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc89Q9DA73 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc89Q9DA73 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc89Q9DA73 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc89Q9DA73 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc89Q9DA73 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc89Q9DA73 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc89Q9DA73 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc89Q9DA73 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc89Q9DA73 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc89Q9DA73 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc89Q9DA73 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc89Q9DA73 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc89Q9DA73 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc89Q9DA73 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc89Q9DA73 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc89Q9DA73 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc89Q9DA73 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc89Q9DA73 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc89Q9DA73 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc89Q9DA73 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc89Q9DA73 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc89Q9DA73 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc89Q9DA73 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc89Q9DA73 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc89Q9DA73 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc89Q9DA73 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc89Q9DA73 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc89Q9DA73 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc89Q9DA73 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc89Q9DA73 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc89Q9DA73 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc89Q9DA73 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc89Q9DA73 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc89Q9DA73 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc89Q9DA73 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc89Q9DA73 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc89Q9DA73 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc89Q9DA73 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc89Q9DA73 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc89Q9DA73 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc89Q9DA73 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc89Q9DA73 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc89Q9DA73 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc89Q9DA73 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc89Q9DA73 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc89Q9DA73 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ccdc89Q9DA73 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc89Q9DA73 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc89Q9DA73 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc89Q9DA73 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc89Q9DA73 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc89Q9DA73 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms