Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9DA42 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9DA42 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9DA42 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Q9DA42 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Q9DA42 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9DA42 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9DA42 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9DA42 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9DA42 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9DA42 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9DA42 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9DA42 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9DA42 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9DA42 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9DA42 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9DA42 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9DA42 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9DA42 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9DA42 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9DA42 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9DA42 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9DA42 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9DA42 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9DA42 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9DA42 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9DA42 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9DA42 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9DA42 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9DA42 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9DA42 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9DA42 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9DA42 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9DA42 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9DA42 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9DA42 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9DA42 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9DA42 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9DA42 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9DA42 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9DA42 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9DA42 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9DA42 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9DA42 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9DA42 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9DA42 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9DA42 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9DA42 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9DA42 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9DA42 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9DA42 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9DA42 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9DA42 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9DA42 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9DA42 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9DA42 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9DA42 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9DA42 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9DA42 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9DA42 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9DA42 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9DA42 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9DA42 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9DA42 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9DA42 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9DA42 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9DA42 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9DA42 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9DA42 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9DA42 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9DA42 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9DA42 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9DA42 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9DA42 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9DA42 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9DA42 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9DA42 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9DA42 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9DA42 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9DA42 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9DA42 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9DA42 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9DA42 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9DA42 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9DA42 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9DA42 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9DA42 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9DA42 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9DA42 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9DA42 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9DA42 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9DA42 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9DA42 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9DA42 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9DA42 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9DA42 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9DA42 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9DA42 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9DA42 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9DA42 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms