Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf138rt1Q9D9M9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf138rt1Q9D9M9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf138rt1Q9D9M9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
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Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf138rt1Q9D9M9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf138rt1Q9D9M9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf138rt1Q9D9M9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf138rt1Q9D9M9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf138rt1Q9D9M9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf138rt1Q9D9M9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf138rt1Q9D9M9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf138rt1Q9D9M9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf138rt1Q9D9M9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf138rt1Q9D9M9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf138rt1Q9D9M9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf138rt1Q9D9M9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf138rt1Q9D9M9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf138rt1Q9D9M9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf138rt1Q9D9M9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf138rt1Q9D9M9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf138rt1Q9D9M9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf138rt1Q9D9M9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf138rt1Q9D9M9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf138rt1Q9D9M9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
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Rnf138rt1Q9D9M9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf138rt1Q9D9M9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf138rt1Q9D9M9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf138rt1Q9D9M9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf138rt1Q9D9M9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf138rt1Q9D9M9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf138rt1Q9D9M9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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Rnf138rt1Q9D9M9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf138rt1Q9D9M9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf138rt1Q9D9M9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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Rnf138rt1Q9D9M9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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Rnf138rt1Q9D9M9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf138rt1Q9D9M9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf138rt1Q9D9M9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf138rt1Q9D9M9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
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