Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H8

UPF0565 protein C2orf69 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9H8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Q9D9H8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Q9D9H8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Q9D9H8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Q9D9H8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Q9D9H8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Q9D9H8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Q9D9H8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Q9D9H8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Q9D9H8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Q9D9H8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Q9D9H8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Q9D9H8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Q9D9H8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Q9D9H8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Q9D9H8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Q9D9H8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Q9D9H8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Q9D9H8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Q9D9H8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Q9D9H8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Q9D9H8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Q9D9H8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Q9D9H8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Q9D9H8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Q9D9H8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Q9D9H8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Q9D9H8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Q9D9H8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Q9D9H8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Q9D9H8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Q9D9H8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Q9D9H8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Q9D9H8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Q9D9H8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Q9D9H8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Q9D9H8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Q9D9H8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Q9D9H8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Q9D9H8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Q9D9H8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Q9D9H8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Q9D9H8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Q9D9H8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Q9D9H8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Q9D9H8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Q9D9H8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Q9D9H8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Q9D9H8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Q9D9H8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Q9D9H8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Q9D9H8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Q9D9H8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Q9D9H8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Q9D9H8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Q9D9H8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Q9D9H8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Q9D9H8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Q9D9H8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Q9D9H8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Q9D9H8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Q9D9H8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Q9D9H8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Q9D9H8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Q9D9H8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Q9D9H8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Q9D9H8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Q9D9H8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Q9D9H8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Q9D9H8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Q9D9H8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Q9D9H8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Q9D9H8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Q9D9H8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Q9D9H8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Q9D9H8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Q9D9H8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Q9D9H8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Q9D9H8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Q9D9H8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Q9D9H8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Q9D9H8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Q9D9H8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Q9D9H8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Q9D9H8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Q9D9H8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Q9D9H8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Q9D9H8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Q9D9H8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Q9D9H8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Q9D9H8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Q9D9H8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Q9D9H8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Q9D9H8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Q9D9H8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Q9D9H8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Q9D9H8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Q9D9H8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Q9D9H8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Q9D9H8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.3 ms