Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9F7

Speer4b, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4bQ9D9F7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Speer4bQ9D9F7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Speer4bQ9D9F7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Speer4bQ9D9F7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Speer4bQ9D9F7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Speer4bQ9D9F7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Speer4bQ9D9F7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Speer4bQ9D9F7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Speer4bQ9D9F7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Speer4bQ9D9F7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Speer4bQ9D9F7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Speer4bQ9D9F7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Speer4bQ9D9F7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Speer4bQ9D9F7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Speer4bQ9D9F7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Speer4bQ9D9F7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Speer4bQ9D9F7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Speer4bQ9D9F7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Speer4bQ9D9F7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Speer4bQ9D9F7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Speer4bQ9D9F7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Speer4bQ9D9F7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Speer4bQ9D9F7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Speer4bQ9D9F7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Speer4bQ9D9F7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Speer4bQ9D9F7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Speer4bQ9D9F7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Speer4bQ9D9F7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Speer4bQ9D9F7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Speer4bQ9D9F7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Speer4bQ9D9F7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Speer4bQ9D9F7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Speer4bQ9D9F7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Speer4bQ9D9F7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Speer4bQ9D9F7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Speer4bQ9D9F7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Speer4bQ9D9F7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Speer4bQ9D9F7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Speer4bQ9D9F7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Speer4bQ9D9F7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Speer4bQ9D9F7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Speer4bQ9D9F7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Speer4bQ9D9F7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Speer4bQ9D9F7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Speer4bQ9D9F7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Speer4bQ9D9F7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Speer4bQ9D9F7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Speer4bQ9D9F7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Speer4bQ9D9F7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Speer4bQ9D9F7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Speer4bQ9D9F7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Speer4bQ9D9F7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Speer4bQ9D9F7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Speer4bQ9D9F7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Speer4bQ9D9F7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Speer4bQ9D9F7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Speer4bQ9D9F7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Speer4bQ9D9F7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Speer4bQ9D9F7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Speer4bQ9D9F7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Speer4bQ9D9F7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Speer4bQ9D9F7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Speer4bQ9D9F7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Speer4bQ9D9F7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Speer4bQ9D9F7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Speer4bQ9D9F7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Speer4bQ9D9F7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Speer4bQ9D9F7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Speer4bQ9D9F7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Speer4bQ9D9F7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Speer4bQ9D9F7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Speer4bQ9D9F7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Speer4bQ9D9F7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Speer4bQ9D9F7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Speer4bQ9D9F7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Speer4bQ9D9F7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Speer4bQ9D9F7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Speer4bQ9D9F7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Speer4bQ9D9F7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Speer4bQ9D9F7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Speer4bQ9D9F7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Speer4bQ9D9F7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Speer4bQ9D9F7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Speer4bQ9D9F7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Speer4bQ9D9F7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Speer4bQ9D9F7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Speer4bQ9D9F7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Speer4bQ9D9F7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Speer4bQ9D9F7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Speer4bQ9D9F7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Speer4bQ9D9F7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Speer4bQ9D9F7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Speer4bQ9D9F7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Speer4bQ9D9F7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Speer4bQ9D9F7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Speer4bQ9D9F7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Speer4bQ9D9F7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Speer4bQ9D9F7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Speer4bQ9D9F7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Speer4bQ9D9F7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms