Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D8N1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D8N1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D8N1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D8N1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D8N1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D8N1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D8N1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D8N1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D8N1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D8N1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D8N1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D8N1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D8N1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D8N1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D8N1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D8N1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D8N1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D8N1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q9D8N1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D8N1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D8N1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D8N1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D8N1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D8N1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D8N1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D8N1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D8N1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D8N1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D8N1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D8N1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D8N1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D8N1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D8N1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D8N1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D8N1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D8N1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D8N1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D8N1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D8N1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D8N1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D8N1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D8N1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D8N1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D8N1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D8N1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D8N1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D8N1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D8N1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D8N1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D8N1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D8N1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D8N1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D8N1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D8N1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D8N1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D8N1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D8N1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D8N1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D8N1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D8N1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D8N1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D8N1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D8N1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D8N1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D8N1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D8N1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D8N1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D8N1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D8N1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D8N1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D8N1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D8N1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D8N1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms