Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Chmp4bQ9D8B3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Chmp4bQ9D8B3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Chmp4bQ9D8B3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Chmp4bQ9D8B3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Chmp4bQ9D8B3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Chmp4bQ9D8B3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Chmp4bQ9D8B3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Chmp4bQ9D8B3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Chmp4bQ9D8B3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Chmp4bQ9D8B3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Chmp4bQ9D8B3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Chmp4bQ9D8B3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Chmp4bQ9D8B3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Chmp4bQ9D8B3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Chmp4bQ9D8B3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chmp4bQ9D8B3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chmp4bQ9D8B3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chmp4bQ9D8B3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chmp4bQ9D8B3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chmp4bQ9D8B3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chmp4bQ9D8B3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chmp4bQ9D8B3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Chmp4bQ9D8B3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Chmp4bQ9D8B3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Chmp4bQ9D8B3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Chmp4bQ9D8B3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Chmp4bQ9D8B3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Chmp4bQ9D8B3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Chmp4bQ9D8B3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Chmp4bQ9D8B3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Chmp4bQ9D8B3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Chmp4bQ9D8B3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Chmp4bQ9D8B3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Chmp4bQ9D8B3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Chmp4bQ9D8B3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Chmp4bQ9D8B3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Chmp4bQ9D8B3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Chmp4bQ9D8B3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Chmp4bQ9D8B3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chmp4bQ9D8B3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chmp4bQ9D8B3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chmp4bQ9D8B3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chmp4bQ9D8B3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chmp4bQ9D8B3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chmp4bQ9D8B3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chmp4bQ9D8B3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chmp4bQ9D8B3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chmp4bQ9D8B3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Chmp4bQ9D8B3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Chmp4bQ9D8B3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Chmp4bQ9D8B3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Chmp4bQ9D8B3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Chmp4bQ9D8B3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chmp4bQ9D8B3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chmp4bQ9D8B3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chmp4bQ9D8B3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chmp4bQ9D8B3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chmp4bQ9D8B3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chmp4bQ9D8B3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Chmp4bQ9D8B3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Chmp4bQ9D8B3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Chmp4bQ9D8B3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Chmp4bQ9D8B3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Chmp4bQ9D8B3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Chmp4bQ9D8B3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Chmp4bQ9D8B3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Chmp4bQ9D8B3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Chmp4bQ9D8B3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Chmp4bQ9D8B3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Chmp4bQ9D8B3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Chmp4bQ9D8B3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Chmp4bQ9D8B3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Chmp4bQ9D8B3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Chmp4bQ9D8B3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Chmp4bQ9D8B3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Chmp4bQ9D8B3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chmp4bQ9D8B3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chmp4bQ9D8B3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chmp4bQ9D8B3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chmp4bQ9D8B3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chmp4bQ9D8B3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chmp4bQ9D8B3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chmp4bQ9D8B3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chmp4bQ9D8B3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chmp4bQ9D8B3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chmp4bQ9D8B3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chmp4bQ9D8B3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chmp4bQ9D8B3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Chmp4bQ9D8B3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Chmp4bQ9D8B3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Chmp4bQ9D8B3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Chmp4bQ9D8B3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Chmp4bQ9D8B3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Chmp4bQ9D8B3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Chmp4bQ9D8B3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Chmp4bQ9D8B3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms