Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnfsf13Q9D777 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnfsf13Q9D777 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnfsf13Q9D777 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnfsf13Q9D777 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnfsf13Q9D777 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnfsf13Q9D777 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnfsf13Q9D777 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnfsf13Q9D777 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnfsf13Q9D777 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnfsf13Q9D777 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnfsf13Q9D777 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnfsf13Q9D777 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnfsf13Q9D777 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnfsf13Q9D777 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnfsf13Q9D777 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnfsf13Q9D777 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnfsf13Q9D777 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnfsf13Q9D777 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnfsf13Q9D777 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnfsf13Q9D777 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnfsf13Q9D777 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnfsf13Q9D777 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnfsf13Q9D777 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnfsf13Q9D777 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnfsf13Q9D777 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnfsf13Q9D777 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnfsf13Q9D777 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnfsf13Q9D777 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnfsf13Q9D777 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnfsf13Q9D777 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnfsf13Q9D777 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnfsf13Q9D777 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnfsf13Q9D777 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnfsf13Q9D777 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnfsf13Q9D777 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnfsf13Q9D777 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnfsf13Q9D777 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnfsf13Q9D777 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnfsf13Q9D777 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnfsf13Q9D777 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnfsf13Q9D777 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnfsf13Q9D777 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnfsf13Q9D777 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnfsf13Q9D777 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnfsf13Q9D777 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnfsf13Q9D777 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnfsf13Q9D777 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnfsf13Q9D777 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnfsf13Q9D777 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnfsf13Q9D777 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnfsf13Q9D777 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnfsf13Q9D777 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnfsf13Q9D777 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnfsf13Q9D777 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnfsf13Q9D777 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnfsf13Q9D777 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnfsf13Q9D777 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnfsf13Q9D777 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnfsf13Q9D777 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnfsf13Q9D777 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnfsf13Q9D777 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnfsf13Q9D777 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnfsf13Q9D777 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnfsf13Q9D777 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnfsf13Q9D777 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnfsf13Q9D777 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnfsf13Q9D777 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnfsf13Q9D777 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnfsf13Q9D777 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnfsf13Q9D777 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnfsf13Q9D777 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Tnfsf13Q9D777 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tnfsf13Q9D777 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tnfsf13Q9D777 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Tnfsf13Q9D777 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tnfsf13Q9D777 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tnfsf13Q9D777 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tnfsf13Q9D777 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tnfsf13Q9D777 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tnfsf13Q9D777 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tnfsf13Q9D777 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnfsf13Q9D777 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnfsf13Q9D777 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnfsf13Q9D777 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnfsf13Q9D777 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnfsf13Q9D777 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnfsf13Q9D777 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnfsf13Q9D777 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnfsf13Q9D777 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnfsf13Q9D777 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnfsf13Q9D777 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnfsf13Q9D777 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnfsf13Q9D777 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnfsf13Q9D777 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnfsf13Q9D777 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnfsf13Q9D777 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnfsf13Q9D777 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnfsf13Q9D777 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnfsf13Q9D777 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms