Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nop56Q9D6Z1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nop56Q9D6Z1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nop56Q9D6Z1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nop56Q9D6Z1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nop56Q9D6Z1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nop56Q9D6Z1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nop56Q9D6Z1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nop56Q9D6Z1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nop56Q9D6Z1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nop56Q9D6Z1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nop56Q9D6Z1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nop56Q9D6Z1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nop56Q9D6Z1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nop56Q9D6Z1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nop56Q9D6Z1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nop56Q9D6Z1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nop56Q9D6Z1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nop56Q9D6Z1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nop56Q9D6Z1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nop56Q9D6Z1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nop56Q9D6Z1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nop56Q9D6Z1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nop56Q9D6Z1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nop56Q9D6Z1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nop56Q9D6Z1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nop56Q9D6Z1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nop56Q9D6Z1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Nop56Q9D6Z1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nop56Q9D6Z1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nop56Q9D6Z1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nop56Q9D6Z1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nop56Q9D6Z1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nop56Q9D6Z1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nop56Q9D6Z1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nop56Q9D6Z1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nop56Q9D6Z1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nop56Q9D6Z1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nop56Q9D6Z1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nop56Q9D6Z1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nop56Q9D6Z1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nop56Q9D6Z1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nop56Q9D6Z1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nop56Q9D6Z1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nop56Q9D6Z1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nop56Q9D6Z1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nop56Q9D6Z1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nop56Q9D6Z1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nop56Q9D6Z1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nop56Q9D6Z1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nop56Q9D6Z1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nop56Q9D6Z1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nop56Q9D6Z1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nop56Q9D6Z1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nop56Q9D6Z1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nop56Q9D6Z1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nop56Q9D6Z1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nop56Q9D6Z1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nop56Q9D6Z1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nop56Q9D6Z1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nop56Q9D6Z1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nop56Q9D6Z1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nop56Q9D6Z1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nop56Q9D6Z1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nop56Q9D6Z1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nop56Q9D6Z1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nop56Q9D6Z1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nop56Q9D6Z1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nop56Q9D6Z1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nop56Q9D6Z1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nop56Q9D6Z1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nop56Q9D6Z1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nop56Q9D6Z1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nop56Q9D6Z1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nop56Q9D6Z1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nop56Q9D6Z1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nop56Q9D6Z1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nop56Q9D6Z1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nop56Q9D6Z1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nop56Q9D6Z1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nop56Q9D6Z1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nop56Q9D6Z1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nop56Q9D6Z1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nop56Q9D6Z1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nop56Q9D6Z1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nop56Q9D6Z1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nop56Q9D6Z1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nop56Q9D6Z1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nop56Q9D6Z1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nop56Q9D6Z1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nop56Q9D6Z1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nop56Q9D6Z1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nop56Q9D6Z1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nop56Q9D6Z1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nop56Q9D6Z1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Nop56Q9D6Z1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nop56Q9D6Z1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nop56Q9D6Z1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nop56Q9D6Z1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nop56Q9D6Z1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms