Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubb4aQ9D6F9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubb4aQ9D6F9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubb4aQ9D6F9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Tubb4aQ9D6F9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tubb4aQ9D6F9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tubb4aQ9D6F9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tubb4aQ9D6F9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tubb4aQ9D6F9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tubb4aQ9D6F9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tubb4aQ9D6F9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubb4aQ9D6F9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubb4aQ9D6F9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubb4aQ9D6F9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubb4aQ9D6F9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubb4aQ9D6F9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tubb4aQ9D6F9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tubb4aQ9D6F9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tubb4aQ9D6F9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Tubb4aQ9D6F9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tubb4aQ9D6F9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tubb4aQ9D6F9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tubb4aQ9D6F9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tubb4aQ9D6F9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tubb4aQ9D6F9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tubb4aQ9D6F9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tubb4aQ9D6F9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tubb4aQ9D6F9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tubb4aQ9D6F9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tubb4aQ9D6F9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tubb4aQ9D6F9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tubb4aQ9D6F9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tubb4aQ9D6F9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tubb4aQ9D6F9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tubb4aQ9D6F9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tubb4aQ9D6F9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tubb4aQ9D6F9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tubb4aQ9D6F9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tubb4aQ9D6F9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tubb4aQ9D6F9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tubb4aQ9D6F9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tubb4aQ9D6F9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tubb4aQ9D6F9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tubb4aQ9D6F9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tubb4aQ9D6F9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tubb4aQ9D6F9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tubb4aQ9D6F9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tubb4aQ9D6F9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tubb4aQ9D6F9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tubb4aQ9D6F9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tubb4aQ9D6F9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tubb4aQ9D6F9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tubb4aQ9D6F9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tubb4aQ9D6F9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tubb4aQ9D6F9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tubb4aQ9D6F9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tubb4aQ9D6F9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tubb4aQ9D6F9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tubb4aQ9D6F9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tubb4aQ9D6F9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tubb4aQ9D6F9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tubb4aQ9D6F9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tubb4aQ9D6F9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubb4aQ9D6F9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubb4aQ9D6F9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubb4aQ9D6F9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubb4aQ9D6F9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubb4aQ9D6F9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubb4aQ9D6F9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubb4aQ9D6F9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubb4aQ9D6F9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubb4aQ9D6F9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubb4aQ9D6F9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubb4aQ9D6F9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubb4aQ9D6F9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubb4aQ9D6F9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubb4aQ9D6F9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubb4aQ9D6F9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubb4aQ9D6F9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubb4aQ9D6F9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubb4aQ9D6F9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubb4aQ9D6F9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubb4aQ9D6F9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubb4aQ9D6F9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubb4aQ9D6F9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubb4aQ9D6F9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubb4aQ9D6F9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubb4aQ9D6F9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubb4aQ9D6F9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tubb4aQ9D6F9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tubb4aQ9D6F9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tubb4aQ9D6F9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tubb4aQ9D6F9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tubb4aQ9D6F9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tubb4aQ9D6F9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tubb4aQ9D6F9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tubb4aQ9D6F9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tubb4aQ9D6F9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tubb4aQ9D6F9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tubb4aQ9D6F9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms