Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttc9bQ9D6E4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttc9bQ9D6E4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttc9bQ9D6E4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttc9bQ9D6E4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttc9bQ9D6E4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttc9bQ9D6E4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc9bQ9D6E4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc9bQ9D6E4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc9bQ9D6E4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc9bQ9D6E4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc9bQ9D6E4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc9bQ9D6E4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc9bQ9D6E4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc9bQ9D6E4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc9bQ9D6E4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc9bQ9D6E4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc9bQ9D6E4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc9bQ9D6E4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc9bQ9D6E4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc9bQ9D6E4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc9bQ9D6E4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc9bQ9D6E4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc9bQ9D6E4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc9bQ9D6E4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc9bQ9D6E4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc9bQ9D6E4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc9bQ9D6E4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc9bQ9D6E4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc9bQ9D6E4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc9bQ9D6E4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc9bQ9D6E4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ttc9bQ9D6E4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ttc9bQ9D6E4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc9bQ9D6E4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc9bQ9D6E4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc9bQ9D6E4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc9bQ9D6E4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc9bQ9D6E4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc9bQ9D6E4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc9bQ9D6E4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc9bQ9D6E4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc9bQ9D6E4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc9bQ9D6E4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc9bQ9D6E4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc9bQ9D6E4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc9bQ9D6E4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc9bQ9D6E4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc9bQ9D6E4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc9bQ9D6E4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc9bQ9D6E4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc9bQ9D6E4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc9bQ9D6E4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc9bQ9D6E4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc9bQ9D6E4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc9bQ9D6E4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc9bQ9D6E4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc9bQ9D6E4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc9bQ9D6E4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc9bQ9D6E4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc9bQ9D6E4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc9bQ9D6E4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc9bQ9D6E4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc9bQ9D6E4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc9bQ9D6E4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ttc9bQ9D6E4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc9bQ9D6E4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc9bQ9D6E4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc9bQ9D6E4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc9bQ9D6E4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc9bQ9D6E4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc9bQ9D6E4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc9bQ9D6E4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc9bQ9D6E4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc9bQ9D6E4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc9bQ9D6E4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc9bQ9D6E4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc9bQ9D6E4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc9bQ9D6E4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc9bQ9D6E4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc9bQ9D6E4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc9bQ9D6E4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc9bQ9D6E4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc9bQ9D6E4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc9bQ9D6E4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc9bQ9D6E4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc9bQ9D6E4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc9bQ9D6E4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc9bQ9D6E4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc9bQ9D6E4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc9bQ9D6E4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc9bQ9D6E4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc9bQ9D6E4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc9bQ9D6E4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc9bQ9D6E4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc9bQ9D6E4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc9bQ9D6E4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc9bQ9D6E4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc9bQ9D6E4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms