Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PudpQ9D5U5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PudpQ9D5U5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PudpQ9D5U5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PudpQ9D5U5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PudpQ9D5U5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PudpQ9D5U5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PudpQ9D5U5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PudpQ9D5U5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PudpQ9D5U5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PudpQ9D5U5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PudpQ9D5U5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PudpQ9D5U5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PudpQ9D5U5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PudpQ9D5U5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PudpQ9D5U5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PudpQ9D5U5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PudpQ9D5U5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PudpQ9D5U5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PudpQ9D5U5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PudpQ9D5U5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PudpQ9D5U5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PudpQ9D5U5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PudpQ9D5U5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PudpQ9D5U5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PudpQ9D5U5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PudpQ9D5U5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PudpQ9D5U5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PudpQ9D5U5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PudpQ9D5U5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PudpQ9D5U5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PudpQ9D5U5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PudpQ9D5U5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PudpQ9D5U5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PudpQ9D5U5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PudpQ9D5U5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PudpQ9D5U5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PudpQ9D5U5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PudpQ9D5U5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PudpQ9D5U5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PudpQ9D5U5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PudpQ9D5U5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PudpQ9D5U5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PudpQ9D5U5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PudpQ9D5U5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PudpQ9D5U5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PudpQ9D5U5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PudpQ9D5U5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PudpQ9D5U5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PudpQ9D5U5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PudpQ9D5U5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PudpQ9D5U5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PudpQ9D5U5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PudpQ9D5U5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PudpQ9D5U5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PudpQ9D5U5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PudpQ9D5U5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PudpQ9D5U5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PudpQ9D5U5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PudpQ9D5U5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PudpQ9D5U5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PudpQ9D5U5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PudpQ9D5U5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PudpQ9D5U5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PudpQ9D5U5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PudpQ9D5U5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PudpQ9D5U5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PudpQ9D5U5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PudpQ9D5U5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PudpQ9D5U5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PudpQ9D5U5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PudpQ9D5U5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PudpQ9D5U5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PudpQ9D5U5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PudpQ9D5U5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PudpQ9D5U5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PudpQ9D5U5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PudpQ9D5U5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PudpQ9D5U5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PudpQ9D5U5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PudpQ9D5U5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PudpQ9D5U5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PudpQ9D5U5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PudpQ9D5U5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PudpQ9D5U5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PudpQ9D5U5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PudpQ9D5U5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PudpQ9D5U5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PudpQ9D5U5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PudpQ9D5U5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PudpQ9D5U5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PudpQ9D5U5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PudpQ9D5U5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PudpQ9D5U5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PudpQ9D5U5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PudpQ9D5U5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PudpQ9D5U5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PudpQ9D5U5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PudpQ9D5U5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PudpQ9D5U5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms