Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gcc1Q9D4H2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Gcc1Q9D4H2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gcc1Q9D4H2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gcc1Q9D4H2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gcc1Q9D4H2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Gcc1Q9D4H2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gcc1Q9D4H2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gcc1Q9D4H2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gcc1Q9D4H2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gcc1Q9D4H2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gcc1Q9D4H2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Gcc1Q9D4H2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gcc1Q9D4H2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gcc1Q9D4H2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gcc1Q9D4H2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gcc1Q9D4H2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gcc1Q9D4H2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gcc1Q9D4H2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gcc1Q9D4H2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gcc1Q9D4H2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gcc1Q9D4H2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Gcc1Q9D4H2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gcc1Q9D4H2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gcc1Q9D4H2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gcc1Q9D4H2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gcc1Q9D4H2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gcc1Q9D4H2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gcc1Q9D4H2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gcc1Q9D4H2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gcc1Q9D4H2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gcc1Q9D4H2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gcc1Q9D4H2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gcc1Q9D4H2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gcc1Q9D4H2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gcc1Q9D4H2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gcc1Q9D4H2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Gcc1Q9D4H2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gcc1Q9D4H2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gcc1Q9D4H2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gcc1Q9D4H2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gcc1Q9D4H2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gcc1Q9D4H2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gcc1Q9D4H2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gcc1Q9D4H2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gcc1Q9D4H2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gcc1Q9D4H2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gcc1Q9D4H2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gcc1Q9D4H2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gcc1Q9D4H2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gcc1Q9D4H2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gcc1Q9D4H2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gcc1Q9D4H2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gcc1Q9D4H2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gcc1Q9D4H2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gcc1Q9D4H2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gcc1Q9D4H2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gcc1Q9D4H2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gcc1Q9D4H2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gcc1Q9D4H2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gcc1Q9D4H2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gcc1Q9D4H2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gcc1Q9D4H2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gcc1Q9D4H2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gcc1Q9D4H2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gcc1Q9D4H2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gcc1Q9D4H2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gcc1Q9D4H2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gcc1Q9D4H2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gcc1Q9D4H2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gcc1Q9D4H2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gcc1Q9D4H2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gcc1Q9D4H2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gcc1Q9D4H2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gcc1Q9D4H2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gcc1Q9D4H2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gcc1Q9D4H2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gcc1Q9D4H2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Gcc1Q9D4H2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gcc1Q9D4H2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gcc1Q9D4H2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gcc1Q9D4H2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gcc1Q9D4H2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gcc1Q9D4H2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gcc1Q9D4H2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gcc1Q9D4H2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gcc1Q9D4H2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gcc1Q9D4H2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gcc1Q9D4H2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gcc1Q9D4H2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gcc1Q9D4H2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gcc1Q9D4H2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gcc1Q9D4H2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gcc1Q9D4H2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gcc1Q9D4H2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gcc1Q9D4H2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gcc1Q9D4H2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gcc1Q9D4H2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gcc1Q9D4H2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gcc1Q9D4H2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms