Protein–RNA interactions for Protein: Q9D489

Sohlh2, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh2Q9D489 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sohlh2Q9D489 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sohlh2Q9D489 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sohlh2Q9D489 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sohlh2Q9D489 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sohlh2Q9D489 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sohlh2Q9D489 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sohlh2Q9D489 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sohlh2Q9D489 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sohlh2Q9D489 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sohlh2Q9D489 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sohlh2Q9D489 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sohlh2Q9D489 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sohlh2Q9D489 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sohlh2Q9D489 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Sohlh2Q9D489 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sohlh2Q9D489 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sohlh2Q9D489 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sohlh2Q9D489 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sohlh2Q9D489 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sohlh2Q9D489 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sohlh2Q9D489 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sohlh2Q9D489 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sohlh2Q9D489 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Sohlh2Q9D489 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sohlh2Q9D489 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Sohlh2Q9D489 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Sohlh2Q9D489 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sohlh2Q9D489 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sohlh2Q9D489 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sohlh2Q9D489 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sohlh2Q9D489 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sohlh2Q9D489 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sohlh2Q9D489 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sohlh2Q9D489 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sohlh2Q9D489 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sohlh2Q9D489 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sohlh2Q9D489 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sohlh2Q9D489 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Sohlh2Q9D489 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sohlh2Q9D489 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sohlh2Q9D489 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sohlh2Q9D489 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sohlh2Q9D489 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sohlh2Q9D489 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sohlh2Q9D489 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sohlh2Q9D489 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sohlh2Q9D489 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sohlh2Q9D489 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sohlh2Q9D489 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sohlh2Q9D489 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sohlh2Q9D489 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sohlh2Q9D489 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sohlh2Q9D489 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sohlh2Q9D489 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sohlh2Q9D489 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sohlh2Q9D489 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sohlh2Q9D489 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sohlh2Q9D489 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sohlh2Q9D489 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sohlh2Q9D489 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sohlh2Q9D489 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sohlh2Q9D489 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sohlh2Q9D489 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sohlh2Q9D489 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sohlh2Q9D489 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sohlh2Q9D489 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sohlh2Q9D489 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sohlh2Q9D489 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sohlh2Q9D489 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sohlh2Q9D489 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sohlh2Q9D489 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sohlh2Q9D489 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sohlh2Q9D489 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sohlh2Q9D489 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Sohlh2Q9D489 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sohlh2Q9D489 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sohlh2Q9D489 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sohlh2Q9D489 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Sohlh2Q9D489 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sohlh2Q9D489 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sohlh2Q9D489 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sohlh2Q9D489 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sohlh2Q9D489 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sohlh2Q9D489 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sohlh2Q9D489 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sohlh2Q9D489 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sohlh2Q9D489 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sohlh2Q9D489 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sohlh2Q9D489 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sohlh2Q9D489 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sohlh2Q9D489 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sohlh2Q9D489 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sohlh2Q9D489 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sohlh2Q9D489 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sohlh2Q9D489 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Sohlh2Q9D489 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sohlh2Q9D489 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sohlh2Q9D489 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sohlh2Q9D489 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms