Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rufy3Q9D394 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rufy3Q9D394 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rufy3Q9D394 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rufy3Q9D394 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Rufy3Q9D394 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rufy3Q9D394 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rufy3Q9D394 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rufy3Q9D394 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rufy3Q9D394 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Rufy3Q9D394 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rufy3Q9D394 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rufy3Q9D394 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rufy3Q9D394 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rufy3Q9D394 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rufy3Q9D394 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rufy3Q9D394 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rufy3Q9D394 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rufy3Q9D394 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rufy3Q9D394 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rufy3Q9D394 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rufy3Q9D394 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rufy3Q9D394 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rufy3Q9D394 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rufy3Q9D394 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rufy3Q9D394 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Rufy3Q9D394 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Rufy3Q9D394 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rufy3Q9D394 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rufy3Q9D394 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rufy3Q9D394 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rufy3Q9D394 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rufy3Q9D394 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rufy3Q9D394 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rufy3Q9D394 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rufy3Q9D394 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rufy3Q9D394 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rufy3Q9D394 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rufy3Q9D394 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rufy3Q9D394 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rufy3Q9D394 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rufy3Q9D394 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rufy3Q9D394 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rufy3Q9D394 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rufy3Q9D394 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rufy3Q9D394 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rufy3Q9D394 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rufy3Q9D394 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rufy3Q9D394 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rufy3Q9D394 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rufy3Q9D394 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rufy3Q9D394 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rufy3Q9D394 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rufy3Q9D394 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rufy3Q9D394 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rufy3Q9D394 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rufy3Q9D394 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rufy3Q9D394 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rufy3Q9D394 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rufy3Q9D394 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rufy3Q9D394 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rufy3Q9D394 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Rufy3Q9D394 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rufy3Q9D394 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rufy3Q9D394 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rufy3Q9D394 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rufy3Q9D394 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rufy3Q9D394 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Rufy3Q9D394 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rufy3Q9D394 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rufy3Q9D394 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rufy3Q9D394 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rufy3Q9D394 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rufy3Q9D394 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rufy3Q9D394 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rufy3Q9D394 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rufy3Q9D394 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rufy3Q9D394 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rufy3Q9D394 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rufy3Q9D394 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rufy3Q9D394 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rufy3Q9D394 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rufy3Q9D394 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rufy3Q9D394 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rufy3Q9D394 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rufy3Q9D394 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rufy3Q9D394 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rufy3Q9D394 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rufy3Q9D394 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rufy3Q9D394 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rufy3Q9D394 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Rufy3Q9D394 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rufy3Q9D394 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rufy3Q9D394 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rufy3Q9D394 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rufy3Q9D394 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rufy3Q9D394 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rufy3Q9D394 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rufy3Q9D394 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rufy3Q9D394 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms