Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt20Q9D312 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt20Q9D312 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt20Q9D312 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt20Q9D312 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt20Q9D312 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt20Q9D312 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt20Q9D312 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt20Q9D312 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt20Q9D312 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt20Q9D312 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt20Q9D312 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt20Q9D312 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt20Q9D312 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt20Q9D312 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt20Q9D312 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt20Q9D312 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt20Q9D312 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt20Q9D312 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt20Q9D312 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt20Q9D312 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt20Q9D312 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt20Q9D312 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt20Q9D312 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt20Q9D312 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt20Q9D312 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt20Q9D312 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt20Q9D312 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt20Q9D312 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt20Q9D312 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt20Q9D312 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt20Q9D312 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt20Q9D312 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Krt20Q9D312 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Krt20Q9D312 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt20Q9D312 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt20Q9D312 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt20Q9D312 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt20Q9D312 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt20Q9D312 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt20Q9D312 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt20Q9D312 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt20Q9D312 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt20Q9D312 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt20Q9D312 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt20Q9D312 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt20Q9D312 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt20Q9D312 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt20Q9D312 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt20Q9D312 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt20Q9D312 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt20Q9D312 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt20Q9D312 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt20Q9D312 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt20Q9D312 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt20Q9D312 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt20Q9D312 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt20Q9D312 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt20Q9D312 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt20Q9D312 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt20Q9D312 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt20Q9D312 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt20Q9D312 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt20Q9D312 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt20Q9D312 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt20Q9D312 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt20Q9D312 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt20Q9D312 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt20Q9D312 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt20Q9D312 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt20Q9D312 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt20Q9D312 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt20Q9D312 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt20Q9D312 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt20Q9D312 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt20Q9D312 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt20Q9D312 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt20Q9D312 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt20Q9D312 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt20Q9D312 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt20Q9D312 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt20Q9D312 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt20Q9D312 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt20Q9D312 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt20Q9D312 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt20Q9D312 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Krt20Q9D312 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Krt20Q9D312 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt20Q9D312 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt20Q9D312 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt20Q9D312 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt20Q9D312 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt20Q9D312 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt20Q9D312 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt20Q9D312 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt20Q9D312 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt20Q9D312 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt20Q9D312 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt20Q9D312 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt20Q9D312 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
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