Protein–RNA interactions for Protein: Q9D226

Krtap5-3, Keratin-associated protein 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap5-3Q9D226 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krtap5-3Q9D226 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krtap5-3Q9D226 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krtap5-3Q9D226 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krtap5-3Q9D226 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krtap5-3Q9D226 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krtap5-3Q9D226 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krtap5-3Q9D226 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krtap5-3Q9D226 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krtap5-3Q9D226 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krtap5-3Q9D226 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krtap5-3Q9D226 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krtap5-3Q9D226 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krtap5-3Q9D226 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krtap5-3Q9D226 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Krtap5-3Q9D226 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krtap5-3Q9D226 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krtap5-3Q9D226 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krtap5-3Q9D226 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krtap5-3Q9D226 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krtap5-3Q9D226 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krtap5-3Q9D226 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krtap5-3Q9D226 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Krtap5-3Q9D226 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krtap5-3Q9D226 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krtap5-3Q9D226 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krtap5-3Q9D226 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krtap5-3Q9D226 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krtap5-3Q9D226 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krtap5-3Q9D226 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krtap5-3Q9D226 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krtap5-3Q9D226 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krtap5-3Q9D226 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Krtap5-3Q9D226 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Krtap5-3Q9D226 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krtap5-3Q9D226 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krtap5-3Q9D226 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krtap5-3Q9D226 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krtap5-3Q9D226 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Krtap5-3Q9D226 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krtap5-3Q9D226 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krtap5-3Q9D226 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krtap5-3Q9D226 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krtap5-3Q9D226 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krtap5-3Q9D226 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Krtap5-3Q9D226 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krtap5-3Q9D226 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krtap5-3Q9D226 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krtap5-3Q9D226 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krtap5-3Q9D226 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krtap5-3Q9D226 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krtap5-3Q9D226 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krtap5-3Q9D226 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krtap5-3Q9D226 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krtap5-3Q9D226 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krtap5-3Q9D226 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Krtap5-3Q9D226 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krtap5-3Q9D226 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krtap5-3Q9D226 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krtap5-3Q9D226 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krtap5-3Q9D226 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krtap5-3Q9D226 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Krtap5-3Q9D226 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Krtap5-3Q9D226 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krtap5-3Q9D226 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krtap5-3Q9D226 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krtap5-3Q9D226 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krtap5-3Q9D226 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krtap5-3Q9D226 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krtap5-3Q9D226 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krtap5-3Q9D226 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krtap5-3Q9D226 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krtap5-3Q9D226 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krtap5-3Q9D226 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krtap5-3Q9D226 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krtap5-3Q9D226 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krtap5-3Q9D226 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krtap5-3Q9D226 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krtap5-3Q9D226 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krtap5-3Q9D226 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krtap5-3Q9D226 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Krtap5-3Q9D226 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Krtap5-3Q9D226 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Krtap5-3Q9D226 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krtap5-3Q9D226 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krtap5-3Q9D226 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krtap5-3Q9D226 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krtap5-3Q9D226 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krtap5-3Q9D226 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krtap5-3Q9D226 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krtap5-3Q9D226 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krtap5-3Q9D226 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krtap5-3Q9D226 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krtap5-3Q9D226 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krtap5-3Q9D226 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krtap5-3Q9D226 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krtap5-3Q9D226 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krtap5-3Q9D226 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krtap5-3Q9D226 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krtap5-3Q9D226 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms