Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lmbr1lQ9D1E5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lmbr1lQ9D1E5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lmbr1lQ9D1E5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lmbr1lQ9D1E5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lmbr1lQ9D1E5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lmbr1lQ9D1E5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lmbr1lQ9D1E5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lmbr1lQ9D1E5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lmbr1lQ9D1E5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lmbr1lQ9D1E5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lmbr1lQ9D1E5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lmbr1lQ9D1E5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lmbr1lQ9D1E5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lmbr1lQ9D1E5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lmbr1lQ9D1E5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Lmbr1lQ9D1E5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Lmbr1lQ9D1E5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lmbr1lQ9D1E5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Lmbr1lQ9D1E5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lmbr1lQ9D1E5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lmbr1lQ9D1E5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lmbr1lQ9D1E5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lmbr1lQ9D1E5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lmbr1lQ9D1E5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lmbr1lQ9D1E5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lmbr1lQ9D1E5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lmbr1lQ9D1E5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lmbr1lQ9D1E5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Lmbr1lQ9D1E5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lmbr1lQ9D1E5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lmbr1lQ9D1E5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lmbr1lQ9D1E5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lmbr1lQ9D1E5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lmbr1lQ9D1E5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lmbr1lQ9D1E5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lmbr1lQ9D1E5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lmbr1lQ9D1E5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Lmbr1lQ9D1E5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lmbr1lQ9D1E5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lmbr1lQ9D1E5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lmbr1lQ9D1E5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lmbr1lQ9D1E5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Lmbr1lQ9D1E5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lmbr1lQ9D1E5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lmbr1lQ9D1E5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lmbr1lQ9D1E5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lmbr1lQ9D1E5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lmbr1lQ9D1E5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lmbr1lQ9D1E5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lmbr1lQ9D1E5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lmbr1lQ9D1E5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lmbr1lQ9D1E5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lmbr1lQ9D1E5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lmbr1lQ9D1E5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Lmbr1lQ9D1E5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lmbr1lQ9D1E5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lmbr1lQ9D1E5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Lmbr1lQ9D1E5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lmbr1lQ9D1E5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lmbr1lQ9D1E5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lmbr1lQ9D1E5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lmbr1lQ9D1E5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lmbr1lQ9D1E5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lmbr1lQ9D1E5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lmbr1lQ9D1E5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lmbr1lQ9D1E5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Lmbr1lQ9D1E5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lmbr1lQ9D1E5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lmbr1lQ9D1E5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lmbr1lQ9D1E5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lmbr1lQ9D1E5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lmbr1lQ9D1E5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lmbr1lQ9D1E5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lmbr1lQ9D1E5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lmbr1lQ9D1E5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lmbr1lQ9D1E5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lmbr1lQ9D1E5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lmbr1lQ9D1E5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lmbr1lQ9D1E5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lmbr1lQ9D1E5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lmbr1lQ9D1E5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lmbr1lQ9D1E5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lmbr1lQ9D1E5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lmbr1lQ9D1E5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Lmbr1lQ9D1E5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Lmbr1lQ9D1E5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lmbr1lQ9D1E5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lmbr1lQ9D1E5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Lmbr1lQ9D1E5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Lmbr1lQ9D1E5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lmbr1lQ9D1E5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms