Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem88Q9D0N8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem88Q9D0N8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem88Q9D0N8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem88Q9D0N8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem88Q9D0N8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem88Q9D0N8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem88Q9D0N8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem88Q9D0N8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem88Q9D0N8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem88Q9D0N8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem88Q9D0N8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem88Q9D0N8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem88Q9D0N8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem88Q9D0N8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem88Q9D0N8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem88Q9D0N8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem88Q9D0N8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem88Q9D0N8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem88Q9D0N8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem88Q9D0N8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem88Q9D0N8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem88Q9D0N8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem88Q9D0N8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem88Q9D0N8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem88Q9D0N8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem88Q9D0N8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem88Q9D0N8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem88Q9D0N8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem88Q9D0N8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem88Q9D0N8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem88Q9D0N8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem88Q9D0N8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem88Q9D0N8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem88Q9D0N8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem88Q9D0N8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem88Q9D0N8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem88Q9D0N8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem88Q9D0N8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem88Q9D0N8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem88Q9D0N8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem88Q9D0N8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem88Q9D0N8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem88Q9D0N8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem88Q9D0N8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem88Q9D0N8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem88Q9D0N8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem88Q9D0N8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem88Q9D0N8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem88Q9D0N8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem88Q9D0N8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem88Q9D0N8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem88Q9D0N8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem88Q9D0N8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem88Q9D0N8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem88Q9D0N8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem88Q9D0N8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem88Q9D0N8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem88Q9D0N8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem88Q9D0N8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem88Q9D0N8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem88Q9D0N8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem88Q9D0N8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem88Q9D0N8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem88Q9D0N8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem88Q9D0N8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem88Q9D0N8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem88Q9D0N8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem88Q9D0N8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem88Q9D0N8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem88Q9D0N8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem88Q9D0N8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem88Q9D0N8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem88Q9D0N8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem88Q9D0N8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem88Q9D0N8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem88Q9D0N8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem88Q9D0N8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem88Q9D0N8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem88Q9D0N8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem88Q9D0N8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem88Q9D0N8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem88Q9D0N8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem88Q9D0N8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem88Q9D0N8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem88Q9D0N8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem88Q9D0N8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem88Q9D0N8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem88Q9D0N8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem88Q9D0N8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem88Q9D0N8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem88Q9D0N8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem88Q9D0N8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem88Q9D0N8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem88Q9D0N8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem88Q9D0N8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem88Q9D0N8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem88Q9D0N8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem88Q9D0N8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem88Q9D0N8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.3 ms