Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Thumpd2Q9CZB3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Thumpd2Q9CZB3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Thumpd2Q9CZB3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Thumpd2Q9CZB3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Thumpd2Q9CZB3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Thumpd2Q9CZB3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Thumpd2Q9CZB3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Thumpd2Q9CZB3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Thumpd2Q9CZB3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Thumpd2Q9CZB3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Thumpd2Q9CZB3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Thumpd2Q9CZB3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Thumpd2Q9CZB3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Thumpd2Q9CZB3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Thumpd2Q9CZB3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Thumpd2Q9CZB3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Thumpd2Q9CZB3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Thumpd2Q9CZB3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Thumpd2Q9CZB3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Thumpd2Q9CZB3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Thumpd2Q9CZB3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Thumpd2Q9CZB3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Thumpd2Q9CZB3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Thumpd2Q9CZB3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Thumpd2Q9CZB3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Thumpd2Q9CZB3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Thumpd2Q9CZB3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Thumpd2Q9CZB3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Thumpd2Q9CZB3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Thumpd2Q9CZB3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Thumpd2Q9CZB3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Thumpd2Q9CZB3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Thumpd2Q9CZB3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Thumpd2Q9CZB3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Thumpd2Q9CZB3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Thumpd2Q9CZB3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Thumpd2Q9CZB3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Thumpd2Q9CZB3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Thumpd2Q9CZB3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Thumpd2Q9CZB3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Thumpd2Q9CZB3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Thumpd2Q9CZB3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Thumpd2Q9CZB3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Thumpd2Q9CZB3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Thumpd2Q9CZB3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Thumpd2Q9CZB3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Thumpd2Q9CZB3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Thumpd2Q9CZB3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Thumpd2Q9CZB3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Thumpd2Q9CZB3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Thumpd2Q9CZB3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Thumpd2Q9CZB3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Thumpd2Q9CZB3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Thumpd2Q9CZB3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Thumpd2Q9CZB3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Thumpd2Q9CZB3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Thumpd2Q9CZB3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Thumpd2Q9CZB3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Thumpd2Q9CZB3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Thumpd2Q9CZB3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Thumpd2Q9CZB3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Thumpd2Q9CZB3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Thumpd2Q9CZB3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Thumpd2Q9CZB3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Thumpd2Q9CZB3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Thumpd2Q9CZB3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Thumpd2Q9CZB3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Thumpd2Q9CZB3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Thumpd2Q9CZB3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Thumpd2Q9CZB3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Thumpd2Q9CZB3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Thumpd2Q9CZB3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Thumpd2Q9CZB3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Thumpd2Q9CZB3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Thumpd2Q9CZB3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Thumpd2Q9CZB3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Thumpd2Q9CZB3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Thumpd2Q9CZB3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Thumpd2Q9CZB3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Thumpd2Q9CZB3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Thumpd2Q9CZB3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Thumpd2Q9CZB3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Thumpd2Q9CZB3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Thumpd2Q9CZB3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Thumpd2Q9CZB3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Thumpd2Q9CZB3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Thumpd2Q9CZB3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Thumpd2Q9CZB3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Thumpd2Q9CZB3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Thumpd2Q9CZB3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Thumpd2Q9CZB3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Thumpd2Q9CZB3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Thumpd2Q9CZB3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Thumpd2Q9CZB3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Thumpd2Q9CZB3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Thumpd2Q9CZB3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Thumpd2Q9CZB3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Thumpd2Q9CZB3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Thumpd2Q9CZB3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms