Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ70

3110001I22Rik, MCG129801, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110001I22RikQ9CZ70 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
3110001I22RikQ9CZ70 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
3110001I22RikQ9CZ70 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
3110001I22RikQ9CZ70 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
3110001I22RikQ9CZ70 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
3110001I22RikQ9CZ70 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
3110001I22RikQ9CZ70 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
3110001I22RikQ9CZ70 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
3110001I22RikQ9CZ70 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
3110001I22RikQ9CZ70 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
3110001I22RikQ9CZ70 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
3110001I22RikQ9CZ70 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
3110001I22RikQ9CZ70 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
3110001I22RikQ9CZ70 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
3110001I22RikQ9CZ70 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
3110001I22RikQ9CZ70 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
3110001I22RikQ9CZ70 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
3110001I22RikQ9CZ70 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
3110001I22RikQ9CZ70 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
3110001I22RikQ9CZ70 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
3110001I22RikQ9CZ70 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
3110001I22RikQ9CZ70 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
3110001I22RikQ9CZ70 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
3110001I22RikQ9CZ70 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
3110001I22RikQ9CZ70 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
3110001I22RikQ9CZ70 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
3110001I22RikQ9CZ70 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
3110001I22RikQ9CZ70 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
3110001I22RikQ9CZ70 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
3110001I22RikQ9CZ70 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
3110001I22RikQ9CZ70 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
3110001I22RikQ9CZ70 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
3110001I22RikQ9CZ70 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
3110001I22RikQ9CZ70 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
3110001I22RikQ9CZ70 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
3110001I22RikQ9CZ70 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
3110001I22RikQ9CZ70 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
3110001I22RikQ9CZ70 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
3110001I22RikQ9CZ70 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
3110001I22RikQ9CZ70 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
3110001I22RikQ9CZ70 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
3110001I22RikQ9CZ70 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
3110001I22RikQ9CZ70 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
3110001I22RikQ9CZ70 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
3110001I22RikQ9CZ70 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
3110001I22RikQ9CZ70 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
3110001I22RikQ9CZ70 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
3110001I22RikQ9CZ70 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
3110001I22RikQ9CZ70 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
3110001I22RikQ9CZ70 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
3110001I22RikQ9CZ70 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
3110001I22RikQ9CZ70 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
3110001I22RikQ9CZ70 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
3110001I22RikQ9CZ70 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
3110001I22RikQ9CZ70 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
3110001I22RikQ9CZ70 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
3110001I22RikQ9CZ70 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
3110001I22RikQ9CZ70 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
3110001I22RikQ9CZ70 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
3110001I22RikQ9CZ70 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
3110001I22RikQ9CZ70 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
3110001I22RikQ9CZ70 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
3110001I22RikQ9CZ70 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
3110001I22RikQ9CZ70 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
3110001I22RikQ9CZ70 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
3110001I22RikQ9CZ70 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
3110001I22RikQ9CZ70 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
3110001I22RikQ9CZ70 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
3110001I22RikQ9CZ70 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
3110001I22RikQ9CZ70 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
3110001I22RikQ9CZ70 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
3110001I22RikQ9CZ70 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
3110001I22RikQ9CZ70 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
3110001I22RikQ9CZ70 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
3110001I22RikQ9CZ70 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
3110001I22RikQ9CZ70 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
3110001I22RikQ9CZ70 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
3110001I22RikQ9CZ70 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
3110001I22RikQ9CZ70 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
3110001I22RikQ9CZ70 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
3110001I22RikQ9CZ70 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
3110001I22RikQ9CZ70 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
3110001I22RikQ9CZ70 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
3110001I22RikQ9CZ70 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
3110001I22RikQ9CZ70 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
3110001I22RikQ9CZ70 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
3110001I22RikQ9CZ70 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
3110001I22RikQ9CZ70 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
3110001I22RikQ9CZ70 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
3110001I22RikQ9CZ70 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
3110001I22RikQ9CZ70 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
3110001I22RikQ9CZ70 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
3110001I22RikQ9CZ70 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
3110001I22RikQ9CZ70 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
3110001I22RikQ9CZ70 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
3110001I22RikQ9CZ70 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
3110001I22RikQ9CZ70 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
3110001I22RikQ9CZ70 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
3110001I22RikQ9CZ70 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
3110001I22RikQ9CZ70 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms