Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gins3Q9CY94 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gins3Q9CY94 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gins3Q9CY94 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gins3Q9CY94 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gins3Q9CY94 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gins3Q9CY94 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gins3Q9CY94 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gins3Q9CY94 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gins3Q9CY94 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gins3Q9CY94 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gins3Q9CY94 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gins3Q9CY94 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gins3Q9CY94 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gins3Q9CY94 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gins3Q9CY94 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gins3Q9CY94 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gins3Q9CY94 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gins3Q9CY94 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gins3Q9CY94 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gins3Q9CY94 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gins3Q9CY94 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gins3Q9CY94 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gins3Q9CY94 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gins3Q9CY94 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gins3Q9CY94 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gins3Q9CY94 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gins3Q9CY94 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gins3Q9CY94 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gins3Q9CY94 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gins3Q9CY94 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gins3Q9CY94 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gins3Q9CY94 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms