Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY50

Ssr1, Translocon-associated protein subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr1Q9CY50 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssr1Q9CY50 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssr1Q9CY50 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssr1Q9CY50 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssr1Q9CY50 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssr1Q9CY50 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssr1Q9CY50 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssr1Q9CY50 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssr1Q9CY50 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssr1Q9CY50 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssr1Q9CY50 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssr1Q9CY50 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssr1Q9CY50 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssr1Q9CY50 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssr1Q9CY50 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssr1Q9CY50 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssr1Q9CY50 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssr1Q9CY50 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssr1Q9CY50 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssr1Q9CY50 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssr1Q9CY50 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssr1Q9CY50 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssr1Q9CY50 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssr1Q9CY50 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssr1Q9CY50 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssr1Q9CY50 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssr1Q9CY50 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssr1Q9CY50 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ssr1Q9CY50 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ssr1Q9CY50 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ssr1Q9CY50 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ssr1Q9CY50 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ssr1Q9CY50 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ssr1Q9CY50 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ssr1Q9CY50 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ssr1Q9CY50 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ssr1Q9CY50 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ssr1Q9CY50 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ssr1Q9CY50 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ssr1Q9CY50 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ssr1Q9CY50 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssr1Q9CY50 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssr1Q9CY50 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssr1Q9CY50 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssr1Q9CY50 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssr1Q9CY50 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssr1Q9CY50 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssr1Q9CY50 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssr1Q9CY50 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssr1Q9CY50 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssr1Q9CY50 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssr1Q9CY50 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssr1Q9CY50 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssr1Q9CY50 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssr1Q9CY50 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssr1Q9CY50 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssr1Q9CY50 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssr1Q9CY50 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssr1Q9CY50 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssr1Q9CY50 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ssr1Q9CY50 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ssr1Q9CY50 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ssr1Q9CY50 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ssr1Q9CY50 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ssr1Q9CY50 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssr1Q9CY50 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssr1Q9CY50 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssr1Q9CY50 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssr1Q9CY50 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssr1Q9CY50 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssr1Q9CY50 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssr1Q9CY50 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssr1Q9CY50 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssr1Q9CY50 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ssr1Q9CY50 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ssr1Q9CY50 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ssr1Q9CY50 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ssr1Q9CY50 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ssr1Q9CY50 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ssr1Q9CY50 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ssr1Q9CY50 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ssr1Q9CY50 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ssr1Q9CY50 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ssr1Q9CY50 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ssr1Q9CY50 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ssr1Q9CY50 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssr1Q9CY50 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssr1Q9CY50 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssr1Q9CY50 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssr1Q9CY50 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ssr1Q9CY50 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ssr1Q9CY50 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ssr1Q9CY50 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ssr1Q9CY50 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ssr1Q9CY50 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ssr1Q9CY50 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ssr1Q9CY50 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ssr1Q9CY50 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ssr1Q9CY50 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ssr1Q9CY50 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms