Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx10Q9CWT3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx10Q9CWT3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx10Q9CWT3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx10Q9CWT3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx10Q9CWT3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx10Q9CWT3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx10Q9CWT3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx10Q9CWT3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx10Q9CWT3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx10Q9CWT3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx10Q9CWT3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx10Q9CWT3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx10Q9CWT3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx10Q9CWT3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx10Q9CWT3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx10Q9CWT3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx10Q9CWT3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx10Q9CWT3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx10Q9CWT3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx10Q9CWT3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx10Q9CWT3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx10Q9CWT3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx10Q9CWT3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx10Q9CWT3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx10Q9CWT3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx10Q9CWT3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx10Q9CWT3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx10Q9CWT3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx10Q9CWT3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx10Q9CWT3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx10Q9CWT3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx10Q9CWT3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx10Q9CWT3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx10Q9CWT3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx10Q9CWT3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx10Q9CWT3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx10Q9CWT3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx10Q9CWT3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx10Q9CWT3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx10Q9CWT3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx10Q9CWT3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx10Q9CWT3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx10Q9CWT3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx10Q9CWT3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx10Q9CWT3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx10Q9CWT3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx10Q9CWT3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx10Q9CWT3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx10Q9CWT3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx10Q9CWT3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx10Q9CWT3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx10Q9CWT3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx10Q9CWT3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx10Q9CWT3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx10Q9CWT3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx10Q9CWT3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx10Q9CWT3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx10Q9CWT3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx10Q9CWT3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx10Q9CWT3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx10Q9CWT3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx10Q9CWT3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx10Q9CWT3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx10Q9CWT3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx10Q9CWT3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx10Q9CWT3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx10Q9CWT3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx10Q9CWT3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx10Q9CWT3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx10Q9CWT3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx10Q9CWT3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snx10Q9CWT3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snx10Q9CWT3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snx10Q9CWT3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snx10Q9CWT3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx10Q9CWT3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx10Q9CWT3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx10Q9CWT3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx10Q9CWT3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx10Q9CWT3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx10Q9CWT3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx10Q9CWT3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx10Q9CWT3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx10Q9CWT3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx10Q9CWT3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx10Q9CWT3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx10Q9CWT3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx10Q9CWT3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx10Q9CWT3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx10Q9CWT3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx10Q9CWT3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx10Q9CWT3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx10Q9CWT3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx10Q9CWT3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx10Q9CWT3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx10Q9CWT3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx10Q9CWT3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx10Q9CWT3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx10Q9CWT3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms