Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atxn3Q9CVD2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atxn3Q9CVD2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Atxn3Q9CVD2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atxn3Q9CVD2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atxn3Q9CVD2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atxn3Q9CVD2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atxn3Q9CVD2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atxn3Q9CVD2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atxn3Q9CVD2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atxn3Q9CVD2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atxn3Q9CVD2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atxn3Q9CVD2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atxn3Q9CVD2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atxn3Q9CVD2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Atxn3Q9CVD2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atxn3Q9CVD2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atxn3Q9CVD2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atxn3Q9CVD2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atxn3Q9CVD2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atxn3Q9CVD2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atxn3Q9CVD2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Atxn3Q9CVD2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Atxn3Q9CVD2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atxn3Q9CVD2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atxn3Q9CVD2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atxn3Q9CVD2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atxn3Q9CVD2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atxn3Q9CVD2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atxn3Q9CVD2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Atxn3Q9CVD2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atxn3Q9CVD2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atxn3Q9CVD2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atxn3Q9CVD2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atxn3Q9CVD2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Atxn3Q9CVD2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atxn3Q9CVD2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atxn3Q9CVD2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atxn3Q9CVD2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atxn3Q9CVD2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atxn3Q9CVD2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atxn3Q9CVD2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atxn3Q9CVD2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Atxn3Q9CVD2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atxn3Q9CVD2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atxn3Q9CVD2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atxn3Q9CVD2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atxn3Q9CVD2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atxn3Q9CVD2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atxn3Q9CVD2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atxn3Q9CVD2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atxn3Q9CVD2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Atxn3Q9CVD2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atxn3Q9CVD2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atxn3Q9CVD2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atxn3Q9CVD2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atxn3Q9CVD2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atxn3Q9CVD2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atxn3Q9CVD2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atxn3Q9CVD2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atxn3Q9CVD2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atxn3Q9CVD2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atxn3Q9CVD2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atxn3Q9CVD2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atxn3Q9CVD2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atxn3Q9CVD2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atxn3Q9CVD2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atxn3Q9CVD2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Atxn3Q9CVD2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atxn3Q9CVD2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atxn3Q9CVD2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atxn3Q9CVD2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atxn3Q9CVD2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atxn3Q9CVD2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atxn3Q9CVD2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atxn3Q9CVD2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atxn3Q9CVD2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atxn3Q9CVD2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atxn3Q9CVD2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atxn3Q9CVD2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Atxn3Q9CVD2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atxn3Q9CVD2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atxn3Q9CVD2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Atxn3Q9CVD2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atxn3Q9CVD2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atxn3Q9CVD2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atxn3Q9CVD2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atxn3Q9CVD2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atxn3Q9CVD2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Atxn3Q9CVD2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atxn3Q9CVD2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atxn3Q9CVD2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atxn3Q9CVD2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atxn3Q9CVD2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atxn3Q9CVD2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atxn3Q9CVD2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atxn3Q9CVD2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atxn3Q9CVD2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atxn3Q9CVD2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Atxn3Q9CVD2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms